RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616614.4

FMR1-216, Transcript of fragile X mental retardation 1, humanhuman

TSL 5

Gene FMR1, Length 1,409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1-216ENST00000616614 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
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FMR1-216ENST00000616614 SSFA2P28290 1259 aa41.59■■■■■ 4.25
FMR1-216ENST00000616614 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
FMR1-216ENST00000616614 UBR3Q6ZT12 1888 aa41.59■■■■■ 4.25
FMR1-216ENST00000616614 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
FMR1-216ENST00000616614 STARD3NLO95772 234 aa41.58■■■■■ 4.25
FMR1-216ENST00000616614 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa41.58■■■■■ 4.25
FMR1-216ENST00000616614 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa41.57■■■■■ 4.25
FMR1-216ENST00000616614 FLAD1Q8NFF5 587 aa41.56■■■■■ 4.24
FMR1-216ENST00000616614 MBIPQ9NS73 344 aa41.56■■■■■ 4.24
FMR1-216ENST00000616614 IFT57Q9NWB7 429 aa41.56■■■■■ 4.24
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FMR1-216ENST00000616614 MSH5O43196 834 aa41.54■■■■■ 4.24
FMR1-216ENST00000616614 A1BGP04217 495 aa41.54■■■■■ 4.24
FMR1-216ENST00000616614 KRT24Q2M2I5 525 aa41.53■■■■■ 4.24
FMR1-216ENST00000616614 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
FMR1-216ENST00000616614 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
FMR1-216ENST00000616614 CANXP27824 592 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
FMR1-216ENST00000616614 GNAI1P63096 354 aa41.52■■■■■ 4.24
FMR1-216ENST00000616614 TRAPPC3LQ5T215 181 aa41.52■■■■■ 4.24
FMR1-216ENST00000616614 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
FMR1-216ENST00000616614 MTFR1LQ9H019 292 aa41.5■■■■■ 4.23
FMR1-216ENST00000616614 SLC16A10Q8TF71 515 aa41.49■■■■■ 4.23
FMR1-216ENST00000616614 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
FMR1-216ENST00000616614 ADRA2BP18089 450 aa41.47■■■■■ 4.23
FMR1-216ENST00000616614 NGEFQ8N5V2 710 aa41.47■■■■■ 4.23
FMR1-216ENST00000616614 WDR63Q8IWG1 891 aa41.46■■■■■ 4.23
FMR1-216ENST00000616614 SPON1Q9HCB6 807 aa41.45■■■■■ 4.23
FMR1-216ENST00000616614 IL16Q14005 1332 aa41.45■■■■■ 4.23
FMR1-216ENST00000616614 PTGER2P43116 358 aa41.44■■■■■ 4.23
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FMR1-216ENST00000616614 ZNF521Q96K83 1311 aa41.44■■■■■ 4.22
FMR1-216ENST00000616614 NBPF26B4DH59 902 aa41.44■■■■■ 4.22
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FMR1-216ENST00000616614 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
FMR1-216ENST00000616614 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
FMR1-216ENST00000616614 SGIP1Q9BQI5 828 aa41.43■■■■■ 4.22
FMR1-216ENST00000616614 MSL1Q68DK7 614 aa41.42■■■■■ 4.22
FMR1-216ENST00000616614 RFC4P35249 363 aa41.41■■■■■ 4.22
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FMR1-216ENST00000616614 COL15A1P39059 1388 aa41.39■■■■■ 4.22
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FMR1-216ENST00000616614 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
FMR1-216ENST00000616614 DUSP27Q5VZP5 1158 aa41.35■■■■■ 4.21
FMR1-216ENST00000616614 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
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FMR1-216ENST00000616614 GYS1P13807 737 aa41.35■■■■■ 4.21
FMR1-216ENST00000616614 LRP5O75197 1615 aa41.34■■■■■ 4.21
FMR1-216ENST00000616614 C4AP0C0L4 1744 aa41.34■■■■■ 4.21
FMR1-216ENST00000616614 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
FMR1-216ENST00000616614 NECTIN2Q92692 538 aa41.33■■■■■ 4.21
FMR1-216ENST00000616614 PDIA6Q15084 440 aa41.32■■■■■ 4.21
FMR1-216ENST00000616614 FANCIQ9NVI1 1328 aa41.32■■■■■ 4.2
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FMR1-216ENST00000616614 BCL2L12Q9HB09 334 aa41.29■■■■■ 4.2
FMR1-216ENST00000616614 COL24A1Q17RW2 1714 aa41.29■■■■■ 4.2
FMR1-216ENST00000616614 A0A087WZG4 1122 aa41.27■■■■■ 4.2
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FMR1-216ENST00000616614 PROSER3Q2NL68 480 aa41.27■■■■■ 4.2
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FMR1-216ENST00000616614 MYL6BP14649 208 aa41.27■■■■■ 4.2
FMR1-216ENST00000616614 LRP10Q7Z4F1 713 aa41.27■■■■■ 4.2
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FMR1-216ENST00000616614 NLGN1Q8N2Q7 840 aa41.24■■■■■ 4.19
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FMR1-216ENST00000616614 CHPF2Q9P2E5 772 aa41.2■■■■■ 4.19
FMR1-216ENST00000616614 MMP10P09238 476 aa41.18■■■■■ 4.18
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FMR1-216ENST00000616614 E9PSI1 815 aa41.13■■■■■ 4.17
FMR1-216ENST00000616614 DDR1Q08345 913 aa41.13■■■■■ 4.17
FMR1-216ENST00000616614 NFIXQ14938 502 aa41.12■■■■■ 4.17
FMR1-216ENST00000616614 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
FMR1-216ENST00000616614 HLFQ16534 295 aa41.11■■■■■ 4.17
FMR1-216ENST00000616614 TBC1D9BQ66K14 1250 aa41.11■■■■■ 4.17
FMR1-216ENST00000616614 VAMP4O75379 141 aa41.1■■■■■ 4.17
FMR1-216ENST00000616614 SCN7AQ01118 1682 aa41.1■■■■■ 4.17
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