RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613424.4

IRF1-211, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene IRF1, Length 821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-211ENST00000613424 USP16Q9Y5T5 823 aa21.69■■□□□ 1.06
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IRF1-211ENST00000613424 IFT57Q9NWB7 429 aa21.68■■□□□ 1.06
IRF1-211ENST00000613424 CASZ1Q86V15 1759 aa21.68■■□□□ 1.06
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IRF1-211ENST00000613424 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.66■■□□□ 1.06
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IRF1-211ENST00000613424 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.65■■□□□ 1.06
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IRF1-211ENST00000613424 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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IRF1-211ENST00000613424 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.44■■□□□ 1.02
IRF1-211ENST00000613424 VAMP4O75379 141 aa21.43■■□□□ 1.02
IRF1-211ENST00000613424 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
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IRF1-211ENST00000613424 HLFQ16534 295 aa21.42■■□□□ 1.02
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