RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580633.5

TSPOAP1-AS1-207, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene TSPOAP1-AS1, Length 842 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ARXQ96QS3 562 aa28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 MRS2Q9HD23 443 aa28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 MIS18AQ9NYP9 233 aa28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 POLD1P28340 1107 aa28.18■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 STARD3NLO95772 234 aa28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 COL15A1P39059 1388 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 APAF1O14727 1248 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NEUROD2Q15784 382 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 GYS1P13807 737 aa28.14■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.14■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SCN7AQ01118 1682 aa28.13■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 RFC4P35249 363 aa28.13■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 EIF5P55010 431 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 USP16Q9Y5T5 823 aa28.13■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SYT17Q9BSW7 474 aa28.12■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 KIF13BQ9NQT8 1826 aa28.11■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 BCORQ6W2J9 1755 aa28.11■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 A1BGP04217 495 aa28.09■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CHL1O00533 1208 aa28.08■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NLGN1Q8N2Q7 840 aa28.08■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 TSPYL4Q9UJ04 414 aa28.08■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NARFQ9UHQ1 456 aa28.07■■■□□ 2.08
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 MMP10P09238 476 aa28.05■■■□□ 2.08
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 FKBP8Q14318 412 aa28.05■■■□□ 2.08
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 BCL2L12Q9HB09 334 aa28.05■■■□□ 2.08
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa28.05■■■□□ 2.08
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NRXN2Q9P2S2 1712 aa28.04■■■□□ 2.08
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NBPF26B4DH59 902 aa28.04■■■□□ 2.08
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NBPF15Q8N660 670 aa28.04■■■□□ 2.08
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ZNF853P0CG23 659 aa28.03■■■□□ 2.08
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 USPL1Q5W0Q7 1092 aa28.03■■■□□ 2.08
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 A0A087WZG4 1122 aa28.01■■■□□ 2.07
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ZPR1O75312 459 aa28.01■■■□□ 2.07
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CCDC27Q2M243 656 aa28.01■■■□□ 2.07
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CFAP44Q96MT7 982 aa28.01■■■□□ 2.07
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.01■■■□□ 2.07
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 C10orf71Q711Q0 1435 aa28.01■■■□□ 2.07
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 TM4SF1P30408 202 aa28■■■□□ 2.07
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 DDR1Q08345 913 aa27.99■■■□□ 2.07
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NLGN2Q8NFZ4 835 aa27.99■■■□□ 2.07
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 IFT57Q9NWB7 429 aa27.97■■■□□ 2.07
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CAMTA2O94983 1202 aa27.96■■■□□ 2.07
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 KLHL34Q8N239 644 aa27.96■■■□□ 2.07
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 MBIPQ9NS73 344 aa27.96■■■□□ 2.07
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.96■■■□□ 2.07
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ERBB4Q15303 1308 aa27.95■■■□□ 2.07
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 KRT24Q2M2I5 525 aa27.95■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NFIXQ14938 502 aa27.94■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 WWC1Q8IX03 1113 aa27.94■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 LRP10Q7Z4F1 713 aa27.93■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.93■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.93■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NUP98P52948 1817 aa27.92■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 GNAI1P63096 354 aa27.92■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CCER2I3L3R5 266 aa27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 RGL2O15211 777 aa27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PDIA6Q15084 440 aa27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 UTRNP46939 3433 aa27.9■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.9■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 HOXB7P09629 217 aa27.9■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 IL16Q14005 1332 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.87■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.87■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PROSER3Q2NL68 480 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 DLEC1Q9Y238 1755 aa27.85■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.84■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 TTLL7Q6ZT98 887 aa27.84■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NGEFQ8N5V2 710 aa27.84■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.84■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SERPINB2P05120 415 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 MYL6BP14649 208 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 TGFB2P61812 414 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms