RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.562e-6■■■■□ 20.7
PTPRM-211ENST00000580170 GPATCH11Q8N954 259 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 CTAGE5O15320 804 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 NAPBQ9H115 298 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGEF11O15085 1522 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 FKBP15Q5T1M5 1219 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 GJB2P29033 226 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 TNNT1P13805 278 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 SSR1P43307 286 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 PTPRCP08575 1304 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 TSG101Q99816 390 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF213O14771 459 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 FSIP1Q8NA03 581 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 CNNM3Q8NE01 707 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 TMX1Q9H3N1 280 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 NCOA1Q15788 1441 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 IGHDP01880 384 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 MAP9Q49MG5 647 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 EVI5LQ96CN4 794 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 STX6O43752 255 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 BMP2KLQ5H9B9 411 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 ADCY5O95622 1261 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 ABCC5O15440 1437 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 EZRP15311 586 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA8AA7E2F4 631 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 MAP3K12Q12852 859 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 CPLX3Q8WVH0 158 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 TICAM2Q86XR7 235 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 BAG4O95429 457 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 STX1AQ16623 288 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 NEMFO60524 1076 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 MCM3P25205 808 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 FLIIQ13045 1269 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 TMC6Q7Z403 805 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 HYPKQ9NX55 129 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 DESP17661 470 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 FAM107BQ9H098 131 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 TTC22Q5TAA0 569 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 POTEJP0CG39 1038 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 GSDMDP57764 484 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 BIN1O00499 593 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 DYNC1I1O14576 645 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 SLC5A1P13866 664 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 YEATS4O95619 227 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 SPDYE4A6NLX3 237 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC113Q9H0I3 377 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
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