RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547169.5

CTDSP2-202, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 1,340 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-202ENST00000547169 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2-202ENST00000547169 GNPATO15228 680 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-202ENST00000547169 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-202ENST00000547169 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-202ENST00000547169 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-202ENST00000547169 MBIPQ9NS73 344 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-202ENST00000547169 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-202ENST00000547169 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2-202ENST00000547169 SSFA2P28290 1259 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-202ENST00000547169 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-202ENST00000547169 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2-202ENST00000547169 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.33■□□□□ 0.85
CTDSP2-202ENST00000547169 SMIM5Q71RC9 77 aa20.33■□□□□ 0.85
CTDSP2-202ENST00000547169 SLC16A10Q8TF71 515 aa20.33■□□□□ 0.85
CTDSP2-202ENST00000547169 ZNF521Q96K83 1311 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDSP2-202ENST00000547169 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDSP2-202ENST00000547169 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CTDSP2-202ENST00000547169 A1BGP04217 495 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDSP2-202ENST00000547169 ADRA2BP18089 450 aa20.31■□□□□ 0.84
CTDSP2-202ENST00000547169 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.31■□□□□ 0.84
CTDSP2-202ENST00000547169 PHF14O94880 888 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDSP2-202ENST00000547169 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CTDSP2-202ENST00000547169 MSH5O43196 834 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-202ENST00000547169 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-202ENST00000547169 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-202ENST00000547169 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-202ENST00000547169 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-202ENST00000547169 CASZ1Q86V15 1759 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2-202ENST00000547169 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-202ENST00000547169 KRT24Q2M2I5 525 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-202ENST00000547169 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2-202ENST00000547169 HOXB7P09629 217 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2-202ENST00000547169 NBPF26B4DH59 902 aa20.27■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 RFC4P35249 363 aa20.27■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.27■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 NBPF15Q8N660 670 aa20.27■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 MTFR1LQ9H019 292 aa20.27■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 A0A087WZG4 1122 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 ZBTB7AO95365 584 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 GOLGA2Q08379 1002 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 SPON1Q9HCB6 807 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 ERBB4Q15303 1308 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 PDIA6Q15084 440 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 NARFQ9UHQ1 456 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 COL15A1P39059 1388 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 E9PSI1 815 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 SLFN5Q08AF3 891 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 TSPYL6Q8N831 410 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 ZPR1O75312 459 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 GYS1P13807 737 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 C4AP0C0L4 1744 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-202ENST00000547169 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 PTGER2P43116 358 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 NECTIN2Q92692 538 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 MYL6BP14649 208 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 VAMP4O75379 141 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 MSL1Q68DK7 614 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 ARXQ96QS3 562 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 CAMTA2O94983 1202 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 POLD1P28340 1107 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 FKBP8Q14318 412 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 PROSER3Q2NL68 480 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 ANXA1P04083 346 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 TM4SF1P30408 202 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-202ENST00000547169 RGL2O15211 777 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2-202ENST00000547169 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2-202ENST00000547169 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2-202ENST00000547169 HYPKQ9NX55 129 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2-202ENST00000547169 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms