RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539921.5

SNHG1-211, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG1, Length 1,071 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-211ENST00000539921 ETAA1Q9NY74 926 aa7.24□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 NUP160Q12769 1436 aa7.24□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 TRIM66O15016 1216 aa7.23□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 ST18O60284 1047 aa7.23□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 MAGEA8P43361 318 aa7.23□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 PLA2G4AP47712 749 aa7.23□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 BIRC2Q13490 618 aa7.23□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 AP1ARQ63HQ0 302 aa7.23□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 CEP135Q66GS9 1140 aa7.23□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 TMCO3Q6UWJ1 677 aa7.23□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 EP400NLQ6ZTU2 488 aa7.23□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.23□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 TCP11Q8WWU5 503 aa7.23□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 DNAAF4Q8WXU2 420 aa7.23□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 MIEF2Q96C03 454 aa7.23□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 PYCARDQ9ULZ3 195 aa7.23□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 ADGRL1O94910 1474 aa7.23□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 PZPP20742 1482 aa7.23□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 GRIN2BQ13224 1484 aa7.23□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 PLEKHD1A6NEE1 506 aa7.22□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 CCP110O43303 1012 aa7.22□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 BRD1O95696 1058 aa7.22□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 MX1P20591 662 aa7.22□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 PRPHP41219 470 aa7.22□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 CD151P48509 253 aa7.22□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 PPP2R5AQ15172 486 aa7.22□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.22□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.22□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 TATDN2Q93075 761 aa7.22□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 ZBTB9Q96C00 473 aa7.22□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 IL17RAQ96F46 866 aa7.22□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 FAXDC2Q96IV6 333 aa7.22□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.22□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 FUCA2Q9BTY2 467 aa7.22□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 CLIP2Q9UDT6 1046 aa7.22□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 KDM6BO15054 1643 aa7.22□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 ADGRL2O95490 1459 aa7.22□□□□□ -1.25
SNHG1-211ENST00000539921 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 GYS2P54840 703 aa7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 GRIK3Q13003 919 aa7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 MVPQ14764 893 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 CCDC96Q2M329 555 aa7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 CCDC158Q5M9N0 1113 aa7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 NEK11Q8NG66 645 aa7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 TSPAN18Q96SJ8 248 aa7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 TOMM22Q9NS69 142 aa7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 HOMER3Q9NSC5 361 aa7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 PCDHB8Q9UN66 801 aa7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 ERBB3P21860 1342 aa7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 DISP1Q96F81 1524 aa7.21□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 A0A1B0GUA9 196 aa7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 FAM177BA6PVY3 158 aa7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 PPFIA4O75335 1185 aa7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 SASH1O94885 1247 aa7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 TUBBP07437 444 aa7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 ELF1P32519 619 aa7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 CLCN6P51797 869 aa7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 NUCB1Q02818 461 aa7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 GBP6Q6ZN66 633 aa7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 CCDC26Q8TAB7 109 aa7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 BICD2Q8TD16 824 aa7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 SMARCE1Q969G3 411 aa7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF428Q96B54 188 aa7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 VEZTQ9HBM0 779 aa7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 STK26Q9P289 416 aa7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 LCMT1Q9UIC8 334 aa7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 DDX19BQ9UMR2 479 aa7.2□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 PDS5BQ9NTI5 1447 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 ADGBQ8N7X0 1667 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 ERCC6Q03468 1493 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 SHANK2Q9UPX8 1470 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 A6NNZ2 444 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 EFCAB8A8MWE9 144 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 PPFIA2O75334 1257 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 CDC45O75419 566 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 CHMLP26374 656 aa7.19□□□□□ -1.26
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