RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
HACE1-211ENST00000521962 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
HACE1-211ENST00000521962 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.69■■□□□ 1.06
HACE1-211ENST00000521962 PHF14O94880 888 aa21.68■■□□□ 1.06
HACE1-211ENST00000521962 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
HACE1-211ENST00000521962 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
HACE1-211ENST00000521962 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
HACE1-211ENST00000521962 KLHL34Q8N239 644 aa21.68■■□□□ 1.06
HACE1-211ENST00000521962 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
HACE1-211ENST00000521962 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.67■■□□□ 1.06
HACE1-211ENST00000521962 CCER2I3L3R5 266 aa21.67■■□□□ 1.06
HACE1-211ENST00000521962 SSFA2P28290 1259 aa21.67■■□□□ 1.06
HACE1-211ENST00000521962 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.67■■□□□ 1.06
HACE1-211ENST00000521962 C4AP0C0L4 1744 aa21.66■■□□□ 1.06
HACE1-211ENST00000521962 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
HACE1-211ENST00000521962 RPS6KA4O75676 772 aa21.65■■□□□ 1.06
HACE1-211ENST00000521962 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.65■■□□□ 1.06
HACE1-211ENST00000521962 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.65■■□□□ 1.06
HACE1-211ENST00000521962 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.64■■□□□ 1.06
HACE1-211ENST00000521962 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 MIER1Q8N108 512 aa21.64■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.63■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.63■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 CHL1O00533 1208 aa21.62■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.62■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 USP16Q9Y5T5 823 aa21.62■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 MSH5O43196 834 aa21.61■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 GRIN3BO60391 1043 aa21.61■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 CCDC27Q2M243 656 aa21.61■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 ZNF853P0CG23 659 aa21.6■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 ADRA2BP18089 450 aa21.6■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 MSL1Q68DK7 614 aa21.6■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 ADCY9O60503 1353 aa21.6■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 STARD3NLO95772 234 aa21.59■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 COL15A1P39059 1388 aa21.59■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.58■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 WWC1Q8IX03 1113 aa21.58■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 CFAP44Q96MT7 982 aa21.58■■□□□ 1.05
HACE1-211ENST00000521962 ATP10DQ9P241 1426 aa21.57■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 A1BGP04217 495 aa21.57■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 KRT24Q2M2I5 525 aa21.57■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 MBIPQ9NS73 344 aa21.57■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.57■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 IFT57Q9NWB7 429 aa21.56■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 NBPF26B4DH59 902 aa21.55■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 NBPF15Q8N660 670 aa21.55■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 SCN7AQ01118 1682 aa21.54■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 GYS1P13807 737 aa21.54■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 RFC4P35249 363 aa21.53■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 GNAI1P63096 354 aa21.52■■□□□ 1.04
HACE1-211ENST00000521962 ZNF521Q96K83 1311 aa21.52■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 IL16Q14005 1332 aa21.51■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.5■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 BCORQ6W2J9 1755 aa21.5■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.49■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 NARFQ9UHQ1 456 aa21.49■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 FKBP8Q14318 412 aa21.48■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.47■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 PDIA6Q15084 440 aa21.47■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.47■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 WDR63Q8IWG1 891 aa21.47■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 NGEFQ8N5V2 710 aa21.47■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.46■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 MMP10P09238 476 aa21.46■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 PROSER3Q2NL68 480 aa21.46■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.46■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 ERBB4Q15303 1308 aa21.46■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.46■■□□□ 1.03
HACE1-211ENST00000521962 A0A087WZG4 1122 aa21.45■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 CAMTA2O94983 1202 aa21.45■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 HOXB7P09629 217 aa21.45■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 IFFO2Q5TF58 517 aa21.45■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.45■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.45■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.45■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 ZPR1O75312 459 aa21.44■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 DDR1Q08345 913 aa21.44■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 NECTIN2Q92692 538 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms