RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514669.5

CTBP1-216, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTBP1, Length 809 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-216ENST00000514669 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.31■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 GNPATO15228 680 aa22.31■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.31■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 USP16Q9Y5T5 823 aa22.31■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 GOLGA2Q08379 1002 aa22.29■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.29■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.29■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.29■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 C4AP0C0L4 1744 aa22.28■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 RPS6KA4O75676 772 aa22.28■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 SSFA2P28290 1259 aa22.28■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.28■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.28■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 HOXB7P09629 217 aa22.27■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 KRT24Q2M2I5 525 aa22.27■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CTBP1-216ENST00000514669 E9PSI1 815 aa22.25■■□□□ 1.15
CTBP1-216ENST00000514669 PHF14O94880 888 aa22.25■■□□□ 1.15
CTBP1-216ENST00000514669 ADRA2BP18089 450 aa22.25■■□□□ 1.15
CTBP1-216ENST00000514669 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.25■■□□□ 1.15
CTBP1-216ENST00000514669 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTBP1-216ENST00000514669 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CTBP1-216ENST00000514669 A1BGP04217 495 aa22.24■■□□□ 1.15
CTBP1-216ENST00000514669 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CTBP1-216ENST00000514669 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.24■■□□□ 1.15
CTBP1-216ENST00000514669 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CTBP1-216ENST00000514669 ERBB4Q15303 1308 aa22.23■■□□□ 1.15
CTBP1-216ENST00000514669 COL15A1P39059 1388 aa22.23■■□□□ 1.15
CTBP1-216ENST00000514669 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTBP1-216ENST00000514669 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CTBP1-216ENST00000514669 SLFN5Q08AF3 891 aa22.22■■□□□ 1.15
CTBP1-216ENST00000514669 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.22■■□□□ 1.15
CTBP1-216ENST00000514669 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.22■■□□□ 1.15
CTBP1-216ENST00000514669 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.22■■□□□ 1.15
CTBP1-216ENST00000514669 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.21■■□□□ 1.15
CTBP1-216ENST00000514669 SMIM5Q71RC9 77 aa22.21■■□□□ 1.15
CTBP1-216ENST00000514669 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 MSH5O43196 834 aa22.2■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 NBPF26B4DH59 902 aa22.19■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 NBPF15Q8N660 670 aa22.19■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 TSPYL6Q8N831 410 aa22.19■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.19■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.19■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.19■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 SCN7AQ01118 1682 aa22.19■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 BCORQ6W2J9 1755 aa22.18■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.18■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 A0A087WZG4 1122 aa22.18■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 RFC4P35249 363 aa22.18■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 NECTIN2Q92692 538 aa22.18■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 MTFR1LQ9H019 292 aa22.16■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 MYL6BP14649 208 aa22.15■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 CACNA1FO60840 1977 aa22.15■■□□□ 1.14
CTBP1-216ENST00000514669 ZBTB7AO95365 584 aa22.14■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 PDIA6Q15084 440 aa22.14■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.14■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.14■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 ZPR1O75312 459 aa22.13■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 NARFQ9UHQ1 456 aa22.13■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 VAMP4O75379 141 aa22.12■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 PROSER3Q2NL68 480 aa22.12■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 LRP5O75197 1615 aa22.12■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 ANXA1P04083 346 aa22.11■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.11■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 GYS1P13807 737 aa22.1■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.1■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 ARXQ96QS3 562 aa22.1■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 STK31Q9BXU1 1019 aa22.1■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 SPON1Q9HCB6 807 aa22.1■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 HYPKQ9NX55 129 aa22.1■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.1■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 MSL1Q68DK7 614 aa22.09■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 NUP98P52948 1817 aa22.08■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 CAMTA2O94983 1202 aa22.08■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.08■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.08■■□□□ 1.13
CTBP1-216ENST00000514669 RGL2O15211 777 aa22.07■■□□□ 1.12
CTBP1-216ENST00000514669 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CTBP1-216ENST00000514669 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.07■■□□□ 1.12
CTBP1-216ENST00000514669 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms