RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 RFC4P35249 363 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-215ENST00000514625 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-215ENST00000514625 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-215ENST00000514625 MSL1Q68DK7 614 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-215ENST00000514625 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-215ENST00000514625 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-215ENST00000514625 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-215ENST00000514625 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-215ENST00000514625 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-215ENST00000514625 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-215ENST00000514625 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-215ENST00000514625 ARXQ96QS3 562 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-215ENST00000514625 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-215ENST00000514625 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-215ENST00000514625 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 USP16Q9Y5T5 823 aa23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 A0A087WZG4 1122 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 ZPR1O75312 459 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.36■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 CCER2I3L3R5 266 aa23.36■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 CHL1O00533 1208 aa23.36■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 A1BGP04217 495 aa23.36■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 COL15A1P39059 1388 aa23.36■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 CFAP44Q96MT7 982 aa23.35■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC27Q2M243 656 aa23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 GYS1P13807 737 aa23.33■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 NARFQ9UHQ1 456 aa23.33■■□□□ 1.33
FAAP20-215ENST00000514625 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.33■■□□□ 1.32
FAAP20-215ENST00000514625 GNAI1P63096 354 aa23.32■■□□□ 1.32
FAAP20-215ENST00000514625 KLHL34Q8N239 644 aa23.32■■□□□ 1.32
FAAP20-215ENST00000514625 IFT57Q9NWB7 429 aa23.32■■□□□ 1.32
FAAP20-215ENST00000514625 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.31■■□□□ 1.32
FAAP20-215ENST00000514625 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
FAAP20-215ENST00000514625 MMP10P09238 476 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-215ENST00000514625 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.3■■□□□ 1.32
FAAP20-215ENST00000514625 C4AP0C0L4 1744 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-215ENST00000514625 WWC1Q8IX03 1113 aa23.29■■□□□ 1.32
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF853P0CG23 659 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-215ENST00000514625 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-215ENST00000514625 NGEFQ8N5V2 710 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-215ENST00000514625 SYT17Q9BSW7 474 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-215ENST00000514625 MBIPQ9NS73 344 aa23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-215ENST00000514625 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
FAAP20-215ENST00000514625 FKBP8Q14318 412 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-215ENST00000514625 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-215ENST00000514625 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.27■■□□□ 1.32
FAAP20-215ENST00000514625 NBPF26B4DH59 902 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-215ENST00000514625 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-215ENST00000514625 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-215ENST00000514625 NBPF15Q8N660 670 aa23.26■■□□□ 1.31
FAAP20-215ENST00000514625 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-215ENST00000514625 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-215ENST00000514625 ERBB4Q15303 1308 aa23.25■■□□□ 1.31
FAAP20-215ENST00000514625 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.24■■□□□ 1.31
FAAP20-215ENST00000514625 HOXB7P09629 217 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-215ENST00000514625 MIER1Q8N108 512 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-215ENST00000514625 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-215ENST00000514625 IL16Q14005 1332 aa23.23■■□□□ 1.31
FAAP20-215ENST00000514625 MYL6BP14649 208 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-215ENST00000514625 KRT24Q2M2I5 525 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-215ENST00000514625 WDR63Q8IWG1 891 aa23.22■■□□□ 1.31
FAAP20-215ENST00000514625 TM4SF1P30408 202 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-215ENST00000514625 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-215ENST00000514625 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.21■■□□□ 1.31
FAAP20-215ENST00000514625 CAMTA2O94983 1202 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-215ENST00000514625 NECTIN2Q92692 538 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.2■■□□□ 1.3
FAAP20-215ENST00000514625 NFIXQ14938 502 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-215ENST00000514625 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-215ENST00000514625 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.19■■□□□ 1.3
FAAP20-215ENST00000514625 DDR1Q08345 913 aa23.18■■□□□ 1.3
FAAP20-215ENST00000514625 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.18■■□□□ 1.3
FAAP20-215ENST00000514625 BICDL1Q6ZP65 573 aa23.18■■□□□ 1.3
FAAP20-215ENST00000514625 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.18■■□□□ 1.3
FAAP20-215ENST00000514625 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
FAAP20-215ENST00000514625 RGL2O15211 777 aa23.17■■□□□ 1.3
FAAP20-215ENST00000514625 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
FAAP20-215ENST00000514625 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.16■■□□□ 1.3
FAAP20-215ENST00000514625 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.16■■□□□ 1.3
FAAP20-215ENST00000514625 SETDB2Q96T68 719 aa23.16■■□□□ 1.3
FAAP20-215ENST00000514625 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
FAAP20-215ENST00000514625 PDIA6Q15084 440 aa23.15■■□□□ 1.3
FAAP20-215ENST00000514625 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
FAAP20-215ENST00000514625 SCN7AQ01118 1682 aa23.15■■□□□ 1.3
FAAP20-215ENST00000514625 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 SERPINB2P05120 415 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-215ENST00000514625 ANXA1P04083 346 aa23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms