RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513726.5

NSD2-223, Transcript of nuclear receptor binding SET domain protein 2, human

TSL 3

Gene NSD2, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSD2-223	ENST00000513726	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		14.87	□□□□□ -0.03
NSD2-223	ENST00000513726	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		14.87	□□□□□ -0.03
NSD2-223	ENST00000513726	C4A	P0C0L4	1744 aa		14.86	□□□□□ -0.03
NSD2-223	ENST00000513726	PHF14	O94880	888 aa		14.86	□□□□□ -0.03
NSD2-223	ENST00000513726	RIPK4	P57078	832 aa		14.86	□□□□□ -0.03
NSD2-223	ENST00000513726	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		14.86	□□□□□ -0.03
NSD2-223	ENST00000513726	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		14.86	□□□□□ -0.03
NSD2-223	ENST00000513726	RFC4	P35249	363 aa		14.85	□□□□□ -0.03
NSD2-223	ENST00000513726	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
NSD2-223	ENST00000513726	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
NSD2-223	ENST00000513726	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
NSD2-223	ENST00000513726	DCTN1	Q14203	1278 aa		14.84	□□□□□ -0.03
NSD2-223	ENST00000513726	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		14.84	□□□□□ -0.03
NSD2-223	ENST00000513726		A0A087WZG4	1122 aa		14.83	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	SYT17	Q9BSW7	474 aa		14.83	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		14.82	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		14.82	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	ZPR1	O75312	459 aa		14.8	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	GYS1	P13807	737 aa		14.8	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		14.8	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	NARF	Q9UHQ1	456 aa		14.8	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		14.8	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	COL15A1	P39059	1388 aa		14.8	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		14.8	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	RGL2	O15211	777 aa		14.79	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	KCNQ3	O43525	872 aa		14.79	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	MSL1	Q68DK7	614 aa		14.79	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	MRS2	Q9HD23	443 aa		14.79	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	CCER2	I3L3R5	266 aa		14.78	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	ERBB4	Q15303	1308 aa		14.77	□□□□□ -0.04
NSD2-223	ENST00000513726	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	SMIM5	Q71RC9	77 aa		14.77	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		14.77	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		14.77	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	USP16	Q9Y5T5	823 aa		14.77	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	CHL1	O00533	1208 aa		14.76	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	APAF1	O14727	1248 aa		14.76	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	MMP10	P09238	476 aa		14.76	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	NEUROD2	Q15784	382 aa		14.76	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	NGEF	Q8N5V2	710 aa		14.76	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		14.76	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	SCN7A	Q01118	1682 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	CHD4	Q14839	1912 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	A1BG	P04217	495 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	CCDC27	Q2M243	656 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	CFAP44	Q96MT7	982 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	HOXB7	P09629	217 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	TM4SF1	P30408	202 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	CCDC184	Q52MB2	194 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	TGFB2	P61812	414 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	GNAI1	P63096	354 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	FKBP8	Q14318	412 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	KLHL34	Q8N239	644 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	IFT57	Q9NWB7	429 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	ZNF853	P0CG23	659 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
NSD2-223	ENST00000513726	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	GRIN3B	O60391	1043 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	IL16	Q14005	1332 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	NUP98	P52948	1817 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	NBPF26	B4DH59	902 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	CAMTA2	O94983	1202 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	NFIX	Q14938	502 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	NBPF15	Q8N660	670 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	CACNA1F	O60840	1977 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	DDR1	Q08345	913 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	GPR162	Q16538	588 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		14.68	□□□□□ -0.06
NSD2-223	ENST00000513726	SETDB2	Q96T68	719 aa		14.67	□□□□□ -0.06

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