RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483670.5

PDCD4-208, Transcript of programmed cell death 4, human

TSL 5

Gene PDCD4, Length 774 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDCD4-208	ENST00000483670	RFC4	P35249	363 aa		33.87	■■■■□ 3.01
PDCD4-208	ENST00000483670	ARX	Q96QS3	562 aa		33.87	■■■■□ 3.01
PDCD4-208	ENST00000483670	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	33.86	■■■■□ 3.01
PDCD4-208	ENST00000483670	C4A	P0C0L4	1744 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PDCD4-208	ENST00000483670	APAF1	O14727	1248 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PDCD4-208	ENST00000483670	SMIM5	Q71RC9	77 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PDCD4-208	ENST00000483670	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PDCD4-208	ENST00000483670	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	33.83	■■■■□ 3.01
PDCD4-208	ENST00000483670	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		33.83	■■■■□ 3.01
PDCD4-208	ENST00000483670	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		33.82	■■■■□ 3
PDCD4-208	ENST00000483670	MSL1	Q68DK7	614 aa		33.81	■■■■□ 3
PDCD4-208	ENST00000483670	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		33.81	■■■■□ 3
PDCD4-208	ENST00000483670	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		33.81	■■■■□ 3
PDCD4-208	ENST00000483670	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	33.8	■■■■□ 3
PDCD4-208	ENST00000483670	COL15A1	P39059	1388 aa		33.79	■■■■□ 3
PDCD4-208	ENST00000483670		A0A087WZG4	1122 aa		33.78	■■■■□ 3
PDCD4-208	ENST00000483670	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
PDCD4-208	ENST00000483670	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
PDCD4-208	ENST00000483670	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		33.77	■■■■□ 3
PDCD4-208	ENST00000483670	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	33.77	■■■■□ 3
PDCD4-208	ENST00000483670	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	33.77	■■■■□ 3
PDCD4-208	ENST00000483670	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	33.77	■■■■□ 3
PDCD4-208	ENST00000483670	ZPR1	O75312	459 aa		33.76	■■■□□ 2.99
PDCD4-208	ENST00000483670	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	33.76	■■■□□ 2.99
PDCD4-208	ENST00000483670	USP16	Q9Y5T5	823 aa		33.76	■■■□□ 2.99
PDCD4-208	ENST00000483670	GYS1	P13807	737 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PDCD4-208	ENST00000483670	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	33.75	■■■□□ 2.99
PDCD4-208	ENST00000483670	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
PDCD4-208	ENST00000483670	CHL1	O00533	1208 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PDCD4-208	ENST00000483670	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	33.73	■■■□□ 2.99
PDCD4-208	ENST00000483670	NARF	Q9UHQ1	456 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PDCD4-208	ENST00000483670	A1BG	P04217	495 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PDCD4-208	ENST00000483670	CCDC27	Q2M243	656 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PDCD4-208	ENST00000483670	CFAP44	Q96MT7	982 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PDCD4-208	ENST00000483670	SYT17	Q9BSW7	474 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PDCD4-208	ENST00000483670	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		33.7	■■■□□ 2.99
PDCD4-208	ENST00000483670	MMP10	P09238	476 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PDCD4-208	ENST00000483670	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	33.68	■■■□□ 2.98
PDCD4-208	ENST00000483670	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	33.68	■■■□□ 2.98
PDCD4-208	ENST00000483670	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		33.67	■■■□□ 2.98
PDCD4-208	ENST00000483670	IFT57	Q9NWB7	429 aa		33.67	■■■□□ 2.98
PDCD4-208	ENST00000483670	CCER2	I3L3R5	266 aa		33.66	■■■□□ 2.98
PDCD4-208	ENST00000483670	GNAI1	P63096	354 aa		33.66	■■■□□ 2.98
PDCD4-208	ENST00000483670	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		33.66	■■■□□ 2.98
PDCD4-208	ENST00000483670	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		33.66	■■■□□ 2.98
PDCD4-208	ENST00000483670	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	33.65	■■■□□ 2.98
PDCD4-208	ENST00000483670	ERBB4	Q15303	1308 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PDCD4-208	ENST00000483670	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PDCD4-208	ENST00000483670	KLHL34	Q8N239	644 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PDCD4-208	ENST00000483670	NGEF	Q8N5V2	710 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PDCD4-208	ENST00000483670	FKBP8	Q14318	412 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PDCD4-208	ENST00000483670	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PDCD4-208	ENST00000483670	ZNF853	P0CG23	659 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PDCD4-208	ENST00000483670	SCN7A	Q01118	1682 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PDCD4-208	ENST00000483670	HOXB7	P09629	217 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PDCD4-208	ENST00000483670	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	33.6	■■■□□ 2.97
PDCD4-208	ENST00000483670	WWC1	Q8IX03	1113 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PDCD4-208	ENST00000483670	NBPF26	B4DH59	902 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PDCD4-208	ENST00000483670	RGL2	O15211	777 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PDCD4-208	ENST00000483670	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
PDCD4-208	ENST00000483670	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
PDCD4-208	ENST00000483670	NBPF15	Q8N660	670 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PDCD4-208	ENST00000483670	MBIP	Q9NS73	344 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PDCD4-208	ENST00000483670	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PDCD4-208	ENST00000483670	TM4SF1	P30408	202 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PDCD4-208	ENST00000483670	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PDCD4-208	ENST00000483670	IL16	Q14005	1332 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PDCD4-208	ENST00000483670	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	33.56	■■■□□ 2.96
PDCD4-208	ENST00000483670	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PDCD4-208	ENST00000483670	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PDCD4-208	ENST00000483670	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PDCD4-208	ENST00000483670	CAMTA2	O94983	1202 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PDCD4-208	ENST00000483670	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PDCD4-208	ENST00000483670	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
PDCD4-208	ENST00000483670	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
PDCD4-208	ENST00000483670	NFIX	Q14938	502 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PDCD4-208	ENST00000483670	WDR63	Q8IWG1	891 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PDCD4-208	ENST00000483670	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PDCD4-208	ENST00000483670	DDR1	Q08345	913 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PDCD4-208	ENST00000483670	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PDCD4-208	ENST00000483670	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PDCD4-208	ENST00000483670	MYL6B	P14649	208 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PDCD4-208	ENST00000483670	TGFB2	P61812	414 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PDCD4-208	ENST00000483670	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PDCD4-208	ENST00000483670	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PDCD4-208	ENST00000483670	KRT24	Q2M2I5	525 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PDCD4-208	ENST00000483670	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PDCD4-208	ENST00000483670	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PDCD4-208	ENST00000483670	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PDCD4-208	ENST00000483670	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PDCD4-208	ENST00000483670	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PDCD4-208	ENST00000483670	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
PDCD4-208	ENST00000483670	PDIA6	Q15084	440 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PDCD4-208	ENST00000483670	SETDB2	Q96T68	719 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PDCD4-208	ENST00000483670	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	33.45	■■■□□ 2.95
PDCD4-208	ENST00000483670	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PDCD4-208	ENST00000483670	SERPINB2	P05120	415 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PDCD4-208	ENST00000483670	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
PDCD4-208	ENST00000483670	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PDCD4-208	ENST00000483670	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		33.43	■■■□□ 2.94

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