RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-208ENST00000475959 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.72□□□□□ -0.05
GTPBP1-208ENST00000475959 NEFMP07197 916 aa14.71□□□□□ -0.05
GTPBP1-208ENST00000475959 POLD1P28340 1107 aa14.71□□□□□ -0.05
GTPBP1-208ENST00000475959 TMPOP42166 694 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GTPBP1-208ENST00000475959 SYT17Q9BSW7 474 aa14.71□□□□□ -0.05
GTPBP1-208ENST00000475959 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GTPBP1-208ENST00000475959 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 GYS1P13807 737 aa14.7□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 ADRA2BP18089 450 aa14.7□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.7□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.7□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 RIPK4P57078 832 aa14.69□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 TRAPPC3LQ5T215 181 aa14.69□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 RUNDC1Q96C34 613 aa14.69□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.68□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 NEUROD2Q15784 382 aa14.68□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.68□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.67□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 ANP32CO43423 234 aa14.67□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 RFC4P35249 363 aa14.67□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 USP16Q9Y5T5 823 aa14.67□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.67□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.66□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 A1BGP04217 495 aa14.66□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 MMP10P09238 476 aa14.66□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 FKBP8Q14318 412 aa14.66□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.66□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.65□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 DDR1Q08345 913 aa14.65□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 USPL1Q5W0Q7 1092 aa14.65□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 MRS2Q9HD23 443 aa14.65□□□□□ -0.06
GTPBP1-208ENST00000475959 NUP98P52948 1817 aa14.64□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 APAF1O14727 1248 aa14.64□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 CHD4Q14839 1912 aa14.64□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 NBPF26B4DH59 902 aa14.63□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 STARD3NLO95772 234 aa14.63□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 NBPF15Q8N660 670 aa14.63□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.62□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 KRT24Q2M2I5 525 aa14.62□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 NARFQ9UHQ1 456 aa14.62□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.62□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.62□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.61□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 CACNA1SQ13698 1873 aa14.61□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.61□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.61□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.6□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 CAMTA2O94983 1202 aa14.6□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 NFIXQ14938 502 aa14.6□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.6□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 ZPR1O75312 459 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.072e-9■□□□□ 9.4
GTPBP1-208ENST00000475959 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-208ENST00000475959 TM4SF1P30408 202 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 CHL1O00533 1208 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 PROSER3Q2NL68 480 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 MBIPQ9NS73 344 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 A0A087WZG4 1122 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 ANXA1P04083 346 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 ZNF853P0CG23 659 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 BABAM1Q9NWV8 329 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 MYL6BP14649 208 aa14.54□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 PDIA6Q15084 440 aa14.54□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 TTLL7Q6ZT98 887 aa14.54□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 NECTIN2Q92692 538 aa14.54□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 CFAP44Q96MT7 982 aa14.54□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 LAMB2P55268 1798 aa14.53□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 SERPINB2P05120 415 aa14.53□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 DPEP1P16444 411 aa14.53□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 GPR162Q16538 588 aa14.53□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.53□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.53□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 NGEFQ8N5V2 710 aa14.53□□□□□ -0.08
GTPBP1-208ENST00000475959 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
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