RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439686.6

ARL6IP4-208, Transcript of ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 4, human

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene ARL6IP4, Length 796 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARL6IP4-208	ENST00000439686	STARD3NL	O95772	234 aa		32.41	■■■□□ 2.78
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
ARL6IP4-208	ENST00000439686	USP16	Q9Y5T5	823 aa		32.4	■■■□□ 2.78
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GYS1	P13807	737 aa		32.39	■■■□□ 2.78
ARL6IP4-208	ENST00000439686	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		32.38	■■■□□ 2.77
ARL6IP4-208	ENST00000439686	A1BG	P04217	495 aa		32.38	■■■□□ 2.77
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
ARL6IP4-208	ENST00000439686	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		32.37	■■■□□ 2.77
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		32.37	■■■□□ 2.77
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32.36	■■■□□ 2.77
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MMP10	P09238	476 aa		32.35	■■■□□ 2.77
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		32.35	■■■□□ 2.77
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		32.34	■■■□□ 2.77
ARL6IP4-208	ENST00000439686	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
ARL6IP4-208	ENST00000439686	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
ARL6IP4-208	ENST00000439686	FKBP8	Q14318	412 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ARL6IP4-208	ENST00000439686	APAF1	O14727	1248 aa		32.32	■■■□□ 2.76
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
ARL6IP4-208	ENST00000439686	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		32.32	■■■□□ 2.76
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MRS2	Q9HD23	443 aa		32.32	■■■□□ 2.76
ARL6IP4-208	ENST00000439686	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.31	■■■□□ 2.76
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZPR1	O75312	459 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NARF	Q9UHQ1	456 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
ARL6IP4-208	ENST00000439686	COL15A1	P39059	1388 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		32.27	■■■□□ 2.76
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
ARL6IP4-208	ENST00000439686	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		32.25	■■■□□ 2.75
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		32.25	■■■□□ 2.75
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NBPF26	B4DH59	902 aa		32.24	■■■□□ 2.75
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TM4SF1	P30408	202 aa		32.24	■■■□□ 2.75
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NBPF15	Q8N660	670 aa		32.24	■■■□□ 2.75
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DDR1	Q08345	913 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ARL6IP4-208	ENST00000439686		A0A087WZG4	1122 aa		32.22	■■■□□ 2.75
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CHL1	O00533	1208 aa		32.21	■■■□□ 2.75
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		32.21	■■■□□ 2.75
ARL6IP4-208	ENST00000439686	C4A	P0C0L4	1744 aa		32.2	■■■□□ 2.75
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		32.2	■■■□□ 2.75
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		32.19	■■■□□ 2.74
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NFIX	Q14938	502 aa		32.18	■■■□□ 2.74
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
ARL6IP4-208	ENST00000439686	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KRT24	Q2M2I5	525 aa		32.16	■■■□□ 2.74
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.15	■■■□□ 2.74
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CAMTA2	O94983	1202 aa		32.15	■■■□□ 2.74
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GPR162	Q16538	588 aa		32.15	■■■□□ 2.74
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		32.15	■■■□□ 2.74
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NGEF	Q8N5V2	710 aa		32.14	■■■□□ 2.74
ARL6IP4-208	ENST00000439686	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		32.14	■■■□□ 2.74
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		32.13	■■■□□ 2.73
ARL6IP4-208	ENST00000439686	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	32.11	■■■□□ 2.73
ARL6IP4-208	ENST00000439686	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
ARL6IP4-208	ENST00000439686	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CFAP44	Q96MT7	982 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ARL6IP4-208	ENST00000439686		A0A0G2JLW4	131 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZNF853	P0CG23	659 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MYL6B	P14649	208 aa		32.09	■■■□□ 2.73
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SERPINB2	P05120	415 aa		32.08	■■■□□ 2.73
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NECTIN2	Q92692	538 aa		32.08	■■■□□ 2.73
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MBIP	Q9NS73	344 aa		32.08	■■■□□ 2.73
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PDIA6	Q15084	440 aa		32.06	■■■□□ 2.72
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
ARL6IP4-208	ENST00000439686	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		32.06	■■■□□ 2.72
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DPEP1	P16444	411 aa		32.05	■■■□□ 2.72
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TGFB2	P61812	414 aa		32.05	■■■□□ 2.72
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		32.05	■■■□□ 2.72
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ANXA1	P04083	346 aa		32.04	■■■□□ 2.72
ARL6IP4-208	ENST00000439686	HLF	Q16534	295 aa		32.04	■■■□□ 2.72
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PROSER3	Q2NL68	480 aa		32.04	■■■□□ 2.72
ARL6IP4-208	ENST00000439686	IFT57	Q9NWB7	429 aa		32.04	■■■□□ 2.72
ARL6IP4-208	ENST00000439686	WWC1	Q8IX03	1113 aa		32.03	■■■□□ 2.72
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		32.02	■■■□□ 2.72
ARL6IP4-208	ENST00000439686	UTRN	P46939	3433 aa		32.01	■■■□□ 2.71
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KCNA3	P22001	575 aa		32.01	■■■□□ 2.71
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GNAI1	P63096	354 aa		32.01	■■■□□ 2.71
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CCDC27	Q2M243	656 aa		32.01	■■■□□ 2.71
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		32.01	■■■□□ 2.71
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SETDB2	Q96T68	719 aa		32.01	■■■□□ 2.71
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		32.01	■■■□□ 2.71
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CHRNA5	P30532	468 aa		31.99	■■■□□ 2.71
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		31.99	■■■□□ 2.71
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		31.99	■■■□□ 2.71
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ERBB4	Q15303	1308 aa		31.98	■■■□□ 2.71
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		31.95	■■■□□ 2.71
ARL6IP4-208	ENST00000439686	YY1	P25490	414 aa		31.95	■■■□□ 2.71

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