RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.58■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 STX6O43752 255 aa24.58■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF76P36508 570 aa24.58■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.58■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa24.58■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 KIF14Q15058 1648 aa24.58■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 CAVIN2O95810 425 aa24.58■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL40Q2TBA0 621 aa24.58■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 BAG4O95429 457 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 FKBP15Q5T1M5 1219 aa24.58■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP45Q92619 1136 aa24.57■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 CUL7Q14999 1698 aa24.57■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 GSDMDP57764 484 aa24.57■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.57■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.57■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 TTC22Q5TAA0 569 aa24.57■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 MAP9Q49MG5 647 aa24.56■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.56■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.56■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 IQCA1Q86XH1 822 aa24.56■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.56■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.56■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 URI1O94763 535 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 TAX1BP1Q86VP1 789 aa24.56■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 IGHDP01880 384 aa24.55■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 MCM3P25205 808 aa24.55■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 UVSSAQ2YD98 709 aa24.55■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 USP5P45974 858 aa24.55■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 CKAP2LQ8IYA6 745 aa24.55■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.55■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL10Q6JEL2 608 aa24.55■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 FSIP1Q8NA03 581 aa24.55■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 TAF3Q5VWG9 929 aa24.54■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 GJB2P29033 226 aa24.54■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.54■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.54■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 HMG20BQ9P0W2 317 aa24.54■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 TNNT1P13805 278 aa24.53■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 CASQ1P31415 396 aa24.53■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 CNNM3Q8NE01 707 aa24.53■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 RAB34Q9BZG1 259 aa24.53■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.53■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 GUCY1B3Q02153 619 aa24.53■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.53■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2HP62256 183 aa24.53■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 MBIPQ9NS73 344 aa24.53■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.53■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087WZG4 1122 aa24.53■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 STX1AQ16623 288 aa24.53■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 TSG101Q99816 390 aa24.53■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.52■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.52■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRL1O94910 1474 aa24.52■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.52■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 CD109Q6YHK3 1445 aa24.52■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 PIK3R4Q99570 1358 aa24.52■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 SLC5A1P13866 664 aa24.52■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.52■■□□□ 1.52
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA8AA7E2F4 631 aa24.51■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 NUCB1Q02818 461 aa24.51■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 PAF1Q8N7H5 531 aa24.51■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD62A6NC57 917 aa24.5■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 IDI1Q13907 227 aa24.5■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 VPS36Q86VN1 386 aa24.5■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.5■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.5■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 CETN2P41208 172 aa24.5■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 DESP17661 470 aa24.5■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa24.5■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.5■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 KIF20AO95235 890 aa24.49■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 ADCY5O95622 1261 aa24.49■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF165P49910 485 aa24.49■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.49■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 EZRP15311 586 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 NOS1P29475 1434 aa24.49■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.49■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.49■■□□□ 1.51
CCSAP-201ENST00000284617 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms