RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
HOXD11-201ENST00000249504 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXD11-201ENST00000249504 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
HOXD11-201ENST00000249504 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXD11-201ENST00000249504 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD11-201ENST00000249504 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXD11-201ENST00000249504 STARD3NLO95772 234 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD11-201ENST00000249504 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXD11-201ENST00000249504 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD11-201ENST00000249504 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD11-201ENST00000249504 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXD11-201ENST00000249504 GNPATO15228 680 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD11-201ENST00000249504 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXD11-201ENST00000249504 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD11-201ENST00000249504 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXD11-201ENST00000249504 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD11-201ENST00000249504 USP16Q9Y5T5 823 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD11-201ENST00000249504 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
HOXD11-201ENST00000249504 PHF14O94880 888 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 KRT24Q2M2I5 525 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 RPS6KA4O75676 772 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 SSFA2P28290 1259 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 TSPYL6Q8N831 410 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 MSH5O43196 834 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 A1BGP04217 495 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 CASZ1Q86V15 1759 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 HOXB7P09629 217 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 SMIM5Q71RC9 77 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD11-201ENST00000249504 VAMP4O75379 141 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 ADRA2BP18089 450 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 CACNA1FO60840 1977 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 NECTIN2Q92692 538 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 COL15A1P39059 1388 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 C4AP0C0L4 1744 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 ERBB4Q15303 1308 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 RFC4P35249 363 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
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HOXD11-201ENST00000249504 ZNF428Q96B54 188 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 NBPF26B4DH59 902 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 NBPF15Q8N660 670 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD11-201ENST00000249504 A0A087WZG4 1122 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 ZBTB7AO95365 584 aa25■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 MYL6BP14649 208 aa25■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 ARXQ96QS3 562 aa25■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 ZPR1O75312 459 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 MTFR1LQ9H019 292 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 ANXA1P04083 346 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 PDIA6Q15084 440 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 NARFQ9UHQ1 456 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
HOXD11-201ENST00000249504 PROSER3Q2NL68 480 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD11-201ENST00000249504 MSL1Q68DK7 614 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD11-201ENST00000249504 SCN7AQ01118 1682 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD11-201ENST00000249504 STK31Q9BXU1 1019 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD11-201ENST00000249504 SPON1Q9HCB6 807 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD11-201ENST00000249504 BCORQ6W2J9 1755 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD11-201ENST00000249504 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD11-201ENST00000249504 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
HOXD11-201ENST00000249504 GYS1P13807 737 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD11-201ENST00000249504 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD11-201ENST00000249504 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXD11-201ENST00000249504 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.91■■□□□ 1.58
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