RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 AampJ3QN89 436 aa20.36■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Txndc16Q7TN22 820 aa20.36■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cct4P80315 539 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dydc2Q9D3X8 139 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmem87aQ8BXN9 555 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Bag1Q60739 355 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cep57l1Q8VDS7 400 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gnat3Q3V3I2 354 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 SrrtQ99MR6 875 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc12a5Q91V14 1138 aa20.34■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ctnnbl1Q9CWL8 563 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmco3Q8BH01 678 aa20.34■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Triml1Q8BVP1 470 aa20.34■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atp10dQ8K2X1 1416 aa20.34■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmx4Q8C0L0 335 aa20.34■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Psrc1Q9D0P7 329 aa20.34■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kif21aQ9QXL2 1672 aa20.34■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NexmifQ5DTT1 1515 aa20.33■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Bag4Q8CI61 457 aa20.33■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa20.33■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Idi2Q8BFZ6 227 aa20.33■□□□□ 0.85
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mum1Q6DID5 682 aa20.33■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lrrfip1Q3UZ39 729 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ppp1r1bQ60829 194 aa20.33■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa20.33■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ttll13A4Q9F6 804 aa20.32■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trim30cD3YVI9 513 aa20.32■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Traf3ip1Q149C2 625 aa20.32■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Klhdc4Q921I2 584 aa20.32■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mns1Q61884 491 aa20.32■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Prkar2bP31324 416 aa20.32■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tubb6Q922F4 447 aa20.32■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cetn1P41209 172 aa20.32■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Znf653Q6YND2 615 aa20.32■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tsg101Q61187 391 aa20.31■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmem143Q8VD26 458 aa20.31■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc1a4O35874 532 aa20.31■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lmod1Q8BVA4 595 aa20.31■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sestd1Q80UK0 696 aa20.31■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Chaf1aQ9QWF0 911 aa20.31■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 GancQ8BVW0 898 aa20.3■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gnl2Q99LH1 728 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fbf1A2A870 1173 aa20.3■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 SlmapQ3URD3 845 aa20.3■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Large2Q5XPT3 690 aa20.3■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gjc1P28229 396 aa20.3■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Frmd3Q8BHD4 595 aa20.3■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa20.3■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dctn1O08788 1281 aa20.3■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rnf41Q8BH75 317 aa20.3■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ankle2Q6P1H6 964 aa20.3■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rnf34Q99KR6 376 aa20.29■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa20.29■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ddx10Q80Y44 875 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Neurog2P70447 263 aa20.29■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Smarcad1Q04692 1021 aa20.28■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dnajc10Q9DC23 793 aa20.28■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tom1l2Q5SRX1 507 aa20.28■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Podxl2Q8CAE9 603 aa20.28■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Naip7Q9JIB3 1402 aa20.28■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Naip6Q9JIB6 1403 aa20.28■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 EzrP26040 586 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ZwintQ9CQU5 252 aa20.28■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ParnQ8VDG3 624 aa20.27■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cfap45Q9D9U9 551 aa20.27■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa20.27■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa20.27■□□□□ 0.84
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cdca8Q8BHX3 289 aa20.27■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Znf394Q9Z1D9 521 aa20.27■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dact3Q0PHV7 610 aa20.26■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Myl3P09542 204 aa20.26■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PrxO55103 1391 aa20.26■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ctnna2Q61301 953 aa20.26■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Txnrd1Q9JMH6 613 aa20.26■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Il16O54824 1322 aa20.26■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rad23bP54728 416 aa20.25■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Xrcc4Q924T3 326 aa20.25■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Bcar3Q9QZK2 820 aa20.25■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Asxl2Q8BZ32 1370 aa20.25■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Taf12Q8VE65 161 aa20.25■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zap70P43404 618 aa20.25■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfml1Q8BSH2 233 aa20.25■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Jarid2Q62315 1234 aa20.24■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa20.24■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cetn2Q9R1K9 172 aa20.24■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mug1P28665 1476 aa20.24■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Def6Q8C2K1 630 aa20.24■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Caskin1Q6P9K8 1431 aa20.23■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Anp32eP97822 260 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Calm1P0DP26 149 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.3 ms