Protein–RNA interactions for Protein: P41209

Cetn1, Centrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cetn1P41209 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39,2■■■■□ 3,87
Cetn1P41209 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Cetn1P41209 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Cetn1P41209 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Cetn1P41209 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Cetn1P41209 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,12■■■■□ 3,21
Cetn1P41209 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,82■■■■□ 3,16
Cetn1P41209 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,06■■■■□ 3,04
Cetn1P41209 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Cetn1P41209 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33,67■■■□□ 2,98
Cetn1P41209 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Cetn1P41209 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,6■■■□□ 2,97
Cetn1P41209 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,28■■■□□ 2,92
Cetn1P41209 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Cetn1P41209 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Cetn1P41209 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Cetn1P41209 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Cetn1P41209 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32,89■■■□□ 2,86
Cetn1P41209 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Cetn1P41209 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Cetn1P41209 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Cetn1P41209 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Cetn1P41209 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Cetn1P41209 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Cetn1P41209 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Cetn1P41209 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Cetn1P41209 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,43■■■□□ 2,78
Cetn1P41209 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Cetn1P41209 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Cetn1P41209 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Cetn1P41209 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,1■■■□□ 2,73
Cetn1P41209 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,07■■■□□ 2,72
Cetn1P41209 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,97■■■□□ 2,71
Cetn1P41209 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Cetn1P41209 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Cetn1P41209 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Cetn1P41209 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,66
Cetn1P41209 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,59■■■□□ 2,65
Cetn1P41209 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Cetn1P41209 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Cetn1P41209 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Cetn1P41209 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,16■■■□□ 2,58
Cetn1P41209 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Cetn1P41209 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Cetn1P41209 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Cetn1P41209 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Cetn1P41209 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Cetn1P41209 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Cetn1P41209 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Cetn1P41209 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Cetn1P41209 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Cetn1P41209 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Cetn1P41209 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Cetn1P41209 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Cetn1P41209 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Cetn1P41209 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Cetn1P41209 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Cetn1P41209 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30,73■■■□□ 2,51
Cetn1P41209 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Cetn1P41209 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Cetn1P41209 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,59■■■□□ 2,49
Cetn1P41209 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Cetn1P41209 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Cetn1P41209 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,54■■■□□ 2,48
Cetn1P41209 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Cetn1P41209 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Cetn1P41209 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Cetn1P41209 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Cetn1P41209 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Cetn1P41209 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,43■■■□□ 2,46
Cetn1P41209 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Cetn1P41209 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,33■■■□□ 2,45
Cetn1P41209 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Cetn1P41209 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,28■■■□□ 2,44
Cetn1P41209 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Cetn1P41209 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Cetn1P41209 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Cetn1P41209 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Cetn1P41209 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Cetn1P41209 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Cetn1P41209 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Cetn1P41209 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Cetn1P41209 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Cetn1P41209 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Cetn1P41209 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Cetn1P41209 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Cetn1P41209 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Cetn1P41209 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Cetn1P41209 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Cetn1P41209 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Cetn1P41209 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
Cetn1P41209 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Cetn1P41209 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Cetn1P41209 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Cetn1P41209 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Cetn1P41209 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Cetn1P41209 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Cetn1P41209 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Cetn1P41209 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Cetn1P41209 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms