Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVW0

Ganc, Neutral alpha-glucosidase C, mousemouse

Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GancQ8BVW0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41,24■■■■■ 4,19
GancQ8BVW0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38,19■■■■□ 3,7
GancQ8BVW0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,67■■■■□ 3,62
GancQ8BVW0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,98■■■■□ 3,35
GancQ8BVW0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,78■■■■□ 3,32
GancQ8BVW0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,1■■■■□ 3,21
GancQ8BVW0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
GancQ8BVW0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
GancQ8BVW0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
GancQ8BVW0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,16
GancQ8BVW0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34,46■■■■□ 3,11
GancQ8BVW0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
GancQ8BVW0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
GancQ8BVW0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,84■■■■□ 3,01
GancQ8BVW0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
GancQ8BVW0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,41■■■□□ 2,94
GancQ8BVW0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
GancQ8BVW0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,22■■■□□ 2,91
GancQ8BVW0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33,16■■■□□ 2,9
GancQ8BVW0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
GancQ8BVW0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,09■■■□□ 2,89
GancQ8BVW0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,07■■■□□ 2,88
GancQ8BVW0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
GancQ8BVW0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
GancQ8BVW0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
GancQ8BVW0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
GancQ8BVW0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
GancQ8BVW0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
GancQ8BVW0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
GancQ8BVW0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
GancQ8BVW0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,59■■■□□ 2,81
GancQ8BVW0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,55■■■□□ 2,8
GancQ8BVW0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
GancQ8BVW0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
GancQ8BVW0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,34■■■□□ 2,77
GancQ8BVW0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
GancQ8BVW0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,07■■■□□ 2,72
GancQ8BVW0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,9■■■□□ 2,7
GancQ8BVW0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
GancQ8BVW0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
GancQ8BVW0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,77■■■□□ 2,68
GancQ8BVW0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,73■■■□□ 2,67
GancQ8BVW0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,5■■■□□ 2,63
GancQ8BVW0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
GancQ8BVW0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,48■■■□□ 2,63
GancQ8BVW0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,47■■■□□ 2,63
GancQ8BVW0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
GancQ8BVW0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,39■■■□□ 2,62
GancQ8BVW0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
GancQ8BVW0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
GancQ8BVW0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31,28■■■□□ 2,6
GancQ8BVW0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,18■■■□□ 2,58
GancQ8BVW0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
GancQ8BVW0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
GancQ8BVW0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,04■■■□□ 2,56
GancQ8BVW0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,97■■■□□ 2,55
GancQ8BVW0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30,97■■■□□ 2,55
GancQ8BVW0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
GancQ8BVW0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30,91■■■□□ 2,54
GancQ8BVW0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
GancQ8BVW0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
GancQ8BVW0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
GancQ8BVW0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,71■■■□□ 2,51
GancQ8BVW0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
GancQ8BVW0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,69■■■□□ 2,5
GancQ8BVW0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,64■■■□□ 2,49
GancQ8BVW0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
GancQ8BVW0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,59■■■□□ 2,49
GancQ8BVW0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
GancQ8BVW0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,55■■■□□ 2,48
GancQ8BVW0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,54■■■□□ 2,48
GancQ8BVW0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,53■■■□□ 2,48
GancQ8BVW0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,52■■■□□ 2,48
GancQ8BVW0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
GancQ8BVW0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,46■■■□□ 2,47
GancQ8BVW0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
GancQ8BVW0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
GancQ8BVW0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
GancQ8BVW0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
GancQ8BVW0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
GancQ8BVW0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30,35■■■□□ 2,45
GancQ8BVW0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
GancQ8BVW0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
GancQ8BVW0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
GancQ8BVW0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
GancQ8BVW0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,27■■■□□ 2,44
GancQ8BVW0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
GancQ8BVW0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
GancQ8BVW0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,23■■■□□ 2,43
GancQ8BVW0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,21■■■□□ 2,43
GancQ8BVW0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
GancQ8BVW0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
GancQ8BVW0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,42
GancQ8BVW0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
GancQ8BVW0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
GancQ8BVW0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,1■■■□□ 2,41
GancQ8BVW0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,04■■■□□ 2,4
GancQ8BVW0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,98■■■□□ 2,39
GancQ8BVW0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,98■■■□□ 2,39
GancQ8BVW0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms