RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		4.4	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		4.4	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		4.4	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.4	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		4.4	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		4.4	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	NEU3	Q9UQ49	428 aa		4.4	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		4.4	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0D9SEW6	157 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1B0GVT2	93 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ANHX	E9PGG2	379 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	MS4A18	H0YCH9	400 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	MFSD11	O43934	449 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TBL1X	O60907	577 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	LCAT	P04180	440 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SPARC	P09486	303 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CTAGE8	P0CG41	777 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ETS1	P14921	441 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	OR1E1	P30953	314 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	DCTD	P32321	178 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	NR2C2	P49116	596 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ENTPD1	P49961	510 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CDH4	P55283	916 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ZP1	P60852	638 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TRADD	Q15628	312 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TWIST1	Q15672	202 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	MPPE1	Q53F39	396 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CEP112	Q8N8E3	955 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ALG14	Q96F25	216 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	OLFM3	Q96PB7	478 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	KRT12	Q99456	494 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	LGMN	Q99538	433 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	EBF3	Q9H4W6	596 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	HPS4	Q9NQG7	708 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	AMACR	Q9UHK6	382 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	NUP205	Q92621	2012 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ILVBL	A1L0T0	632 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934		H7C0C1	242 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC188	H7C350	402 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934		J3KR12	359 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	KCNK1	O00180	336 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	DFFA	O00273	331 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	RAD51C	O43502	376 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CLDN11	O75508	207 aa		4.38	□□□□□ -1.71

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