RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nrn1lQ8C4W3 162 aa20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prmt5Q8CIG8 637 aa20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TrhdeQ8K093 1025 aa20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ebf4Q8K4J2 599 aa20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Guca1bQ8VBV8 201 aa20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc8b1Q925Q3 585 aa20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp4f3Q99N16 524 aa20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ska1Q9CPV1 254 aa20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ift46Q9DB07 301 aa20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3752A6NAT4 150 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pramef20B1ARV6 477 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp563B8JJZ9 448 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r7E9PYL5 915 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r3H3BJ88 915 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm2888K7N746 267 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr237-ps1K9J725 310 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HalP35492 657 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ThrspQ62264 150 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nadsyn1Q711T7 725 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr845Q7TRG2 312 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nrde2Q80XC6 1172 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hmbox1Q8BJA3 419 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PgghgQ8BP56 690 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cpsf4Q8BQZ5 211 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ifnl3Q8CGK6 193 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r234Q8R298 329 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cbr4Q91VT4 236 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp2r2dQ925E7 453 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc26a5Q99NH7 744 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kdelr2Q9CQM2 212 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm16286Q9CQX6 220 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mcm8Q9CWV1 833 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Uqcrc2Q9DB77 453 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SrpraQ9DBG7 636 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Scamp4Q9JKV5 230 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnajb1Q9QYJ3 340 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nlrp1bA1Z198 1177 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm6569D3YTM9 175 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vsig10lD3YZF7 868 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rhox2hK7N6P1 191 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smpd2O70572 419 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ltb4rO88855 351 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PahP16331 453 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PlaaP27612 794 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ceacam1P31809 521 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Apoa1Q00623 264 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fgfr3Q61851 801 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cfap206Q6PE87 622 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mapre3Q6PER3 281 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wfikkn2Q7TQN3 571 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atl1Q8BH66 558 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dhcr24Q8VCH6 516 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sp7Q8VI67 428 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc22a7Q91WU2 540 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klk6Q91Y82 253 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ceacam2Q925P2 520 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr37l1Q99JG2 481 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm26657Q9CVR1 127 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ephx1Q9D379 455 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Phc2Q9QWH1 850 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 B4galt6Q9WVK5 382 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Elf4Q9Z2U4 655 aa20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr675A0A1B0GSE1 317 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp738B8JJX8 793 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 E9Q0B3 247 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BckdhaP50136 442 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CntfP51642 198 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ezh1P70351 747 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sec24aQ3U2P1 1090 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tex10Q3URQ0 928 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sfmbt2Q5DTW2 938 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pkp4Q68FH0 1190 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DgkbQ6NS52 802 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pik3c3Q6PF93 887 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psmd11Q8BG32 422 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rcn3Q8BH97 328 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tyw1Q8BJM7 721 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc49a3Q8CE47 516 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q8K039 155 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 LctlQ8K1F9 566 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spin4Q8K1L2 249 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Angptl7Q8R1Q3 337 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eif3mQ99JX4 374 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q9CWU4 180 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q9CZV2 255 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q9D1F3 157 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q9D1K7 174 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HaghlQ9DB32 283 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AcoxlQ9DBS4 632 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm29394H3BIW7 199 aa20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cldn4O35054 210 aa20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ms4a15Q3UPL6 245 aa20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Osbp2Q5QNQ6 908 aa20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Phf12Q5SPL2 1003 aa20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adam29Q811Q4 763 aa20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spon2Q8BMS2 330 aa20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr575Q8VH16 318 aa20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Asb17Q8VHP9 295 aa20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Serpinb11Q9CQV3 388 aa20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psg23Q9D2U0 471 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.1 ms