Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1L2

Spin4, Spindlin-4, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin4Q8K1L2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Spin4Q8K1L2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Spin4Q8K1L2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Spin4Q8K1L2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Spin4Q8K1L2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Spin4Q8K1L2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Spin4Q8K1L2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Spin4Q8K1L2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Spin4Q8K1L2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Spin4Q8K1L2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Spin4Q8K1L2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Spin4Q8K1L2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Spin4Q8K1L2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Spin4Q8K1L2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Spin4Q8K1L2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Spin4Q8K1L2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Spin4Q8K1L2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Spin4Q8K1L2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Spin4Q8K1L2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Spin4Q8K1L2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Spin4Q8K1L2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Spin4Q8K1L2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Spin4Q8K1L2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Spin4Q8K1L2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Spin4Q8K1L2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Spin4Q8K1L2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Spin4Q8K1L2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Spin4Q8K1L2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Spin4Q8K1L2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Spin4Q8K1L2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Spin4Q8K1L2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Spin4Q8K1L2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Spin4Q8K1L2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Spin4Q8K1L2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Spin4Q8K1L2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Spin4Q8K1L2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Spin4Q8K1L2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Spin4Q8K1L2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Spin4Q8K1L2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Spin4Q8K1L2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Spin4Q8K1L2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spin4Q8K1L2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Spin4Q8K1L2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Spin4Q8K1L2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Spin4Q8K1L2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Spin4Q8K1L2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Spin4Q8K1L2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Spin4Q8K1L2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Spin4Q8K1L2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Spin4Q8K1L2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Spin4Q8K1L2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Spin4Q8K1L2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Spin4Q8K1L2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spin4Q8K1L2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Spin4Q8K1L2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Spin4Q8K1L2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Spin4Q8K1L2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Spin4Q8K1L2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spin4Q8K1L2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Spin4Q8K1L2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Spin4Q8K1L2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spin4Q8K1L2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spin4Q8K1L2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Spin4Q8K1L2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spin4Q8K1L2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Spin4Q8K1L2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Spin4Q8K1L2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Spin4Q8K1L2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Spin4Q8K1L2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Spin4Q8K1L2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Spin4Q8K1L2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Spin4Q8K1L2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Spin4Q8K1L2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Spin4Q8K1L2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Spin4Q8K1L2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Spin4Q8K1L2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Spin4Q8K1L2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Spin4Q8K1L2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Spin4Q8K1L2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Spin4Q8K1L2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Spin4Q8K1L2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Spin4Q8K1L2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Spin4Q8K1L2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Spin4Q8K1L2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Spin4Q8K1L2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Spin4Q8K1L2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Spin4Q8K1L2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spin4Q8K1L2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Spin4Q8K1L2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Spin4Q8K1L2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Spin4Q8K1L2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Spin4Q8K1L2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Spin4Q8K1L2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Spin4Q8K1L2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Spin4Q8K1L2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Spin4Q8K1L2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Spin4Q8K1L2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Spin4Q8K1L2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Spin4Q8K1L2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Spin4Q8K1L2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms