Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1L2

Spin4, Spindlin-4, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin4Q8K1L2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,53■■■■□ 3,12
Spin4Q8K1L2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Spin4Q8K1L2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Spin4Q8K1L2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,73■■■□□ 2,67
Spin4Q8K1L2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Spin4Q8K1L2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Spin4Q8K1L2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,81■■■□□ 2,52
Spin4Q8K1L2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,53■■■□□ 2,48
Spin4Q8K1L2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Spin4Q8K1L2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,21■■■□□ 2,43
Spin4Q8K1L2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Spin4Q8K1L2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Spin4Q8K1L2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,82■■■□□ 2,36
Spin4Q8K1L2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Spin4Q8K1L2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,64■■■□□ 2,34
Spin4Q8K1L2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Spin4Q8K1L2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Spin4Q8K1L2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Spin4Q8K1L2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Spin4Q8K1L2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Spin4Q8K1L2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Spin4Q8K1L2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Spin4Q8K1L2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Spin4Q8K1L2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Spin4Q8K1L2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Spin4Q8K1L2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Spin4Q8K1L2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Spin4Q8K1L2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Spin4Q8K1L2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Spin4Q8K1L2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Spin4Q8K1L2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Spin4Q8K1L2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Spin4Q8K1L2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Spin4Q8K1L2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Spin4Q8K1L2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Spin4Q8K1L2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Spin4Q8K1L2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Spin4Q8K1L2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Spin4Q8K1L2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Spin4Q8K1L2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Spin4Q8K1L2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Spin4Q8K1L2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,26■■■□□ 2,11
Spin4Q8K1L2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Spin4Q8K1L2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Spin4Q8K1L2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,06■■■□□ 2,08
Spin4Q8K1L2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Spin4Q8K1L2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Spin4Q8K1L2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Spin4Q8K1L2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Spin4Q8K1L2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Spin4Q8K1L2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Spin4Q8K1L2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Spin4Q8K1L2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Spin4Q8K1L2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Spin4Q8K1L2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,42■■□□□ 1,98
Spin4Q8K1L2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Spin4Q8K1L2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Spin4Q8K1L2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Spin4Q8K1L2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Spin4Q8K1L2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Spin4Q8K1L2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Spin4Q8K1L2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Spin4Q8K1L2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
Spin4Q8K1L2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Spin4Q8K1L2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Spin4Q8K1L2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Spin4Q8K1L2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Spin4Q8K1L2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
Spin4Q8K1L2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Spin4Q8K1L2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,03■■□□□ 1,92
Spin4Q8K1L2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Spin4Q8K1L2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Spin4Q8K1L2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Spin4Q8K1L2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Spin4Q8K1L2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Spin4Q8K1L2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Spin4Q8K1L2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Spin4Q8K1L2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Spin4Q8K1L2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Spin4Q8K1L2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Spin4Q8K1L2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Spin4Q8K1L2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Spin4Q8K1L2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Spin4Q8K1L2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Spin4Q8K1L2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Spin4Q8K1L2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Spin4Q8K1L2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Spin4Q8K1L2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Spin4Q8K1L2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Spin4Q8K1L2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Spin4Q8K1L2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Spin4Q8K1L2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Spin4Q8K1L2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Spin4Q8K1L2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Spin4Q8K1L2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Spin4Q8K1L2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Spin4Q8K1L2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Spin4Q8K1L2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Spin4Q8K1L2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Spin4Q8K1L2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,5 ms