Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH97

Rcn3, Reticulocalbin-3, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn3Q8BH97 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rcn3Q8BH97 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Rcn3Q8BH97 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rcn3Q8BH97 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rcn3Q8BH97 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Rcn3Q8BH97 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rcn3Q8BH97 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rcn3Q8BH97 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rcn3Q8BH97 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rcn3Q8BH97 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rcn3Q8BH97 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rcn3Q8BH97 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rcn3Q8BH97 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rcn3Q8BH97 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rcn3Q8BH97 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rcn3Q8BH97 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rcn3Q8BH97 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rcn3Q8BH97 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rcn3Q8BH97 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rcn3Q8BH97 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rcn3Q8BH97 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rcn3Q8BH97 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rcn3Q8BH97 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rcn3Q8BH97 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Rcn3Q8BH97 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rcn3Q8BH97 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rcn3Q8BH97 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rcn3Q8BH97 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rcn3Q8BH97 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rcn3Q8BH97 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rcn3Q8BH97 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rcn3Q8BH97 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rcn3Q8BH97 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rcn3Q8BH97 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rcn3Q8BH97 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rcn3Q8BH97 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rcn3Q8BH97 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Rcn3Q8BH97 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rcn3Q8BH97 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rcn3Q8BH97 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rcn3Q8BH97 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rcn3Q8BH97 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rcn3Q8BH97 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rcn3Q8BH97 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rcn3Q8BH97 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rcn3Q8BH97 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rcn3Q8BH97 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rcn3Q8BH97 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rcn3Q8BH97 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rcn3Q8BH97 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rcn3Q8BH97 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rcn3Q8BH97 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rcn3Q8BH97 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rcn3Q8BH97 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rcn3Q8BH97 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rcn3Q8BH97 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rcn3Q8BH97 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rcn3Q8BH97 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rcn3Q8BH97 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rcn3Q8BH97 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rcn3Q8BH97 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rcn3Q8BH97 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rcn3Q8BH97 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rcn3Q8BH97 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rcn3Q8BH97 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rcn3Q8BH97 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rcn3Q8BH97 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rcn3Q8BH97 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Rcn3Q8BH97 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rcn3Q8BH97 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rcn3Q8BH97 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rcn3Q8BH97 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rcn3Q8BH97 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rcn3Q8BH97 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rcn3Q8BH97 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rcn3Q8BH97 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rcn3Q8BH97 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rcn3Q8BH97 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rcn3Q8BH97 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rcn3Q8BH97 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rcn3Q8BH97 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rcn3Q8BH97 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rcn3Q8BH97 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rcn3Q8BH97 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rcn3Q8BH97 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rcn3Q8BH97 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rcn3Q8BH97 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rcn3Q8BH97 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rcn3Q8BH97 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rcn3Q8BH97 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rcn3Q8BH97 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rcn3Q8BH97 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rcn3Q8BH97 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rcn3Q8BH97 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rcn3Q8BH97 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rcn3Q8BH97 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rcn3Q8BH97 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rcn3Q8BH97 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rcn3Q8BH97 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rcn3Q8BH97 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms