Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2U4

Elf4, ETS-related transcription factor Elf-4, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf4Q9Z2U4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
Elf4Q9Z2U4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Elf4Q9Z2U4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Elf4Q9Z2U4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Elf4Q9Z2U4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Elf4Q9Z2U4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Elf4Q9Z2U4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Elf4Q9Z2U4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Elf4Q9Z2U4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Elf4Q9Z2U4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Elf4Q9Z2U4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Elf4Q9Z2U4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Elf4Q9Z2U4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Elf4Q9Z2U4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Elf4Q9Z2U4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Elf4Q9Z2U4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Elf4Q9Z2U4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Elf4Q9Z2U4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Elf4Q9Z2U4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Elf4Q9Z2U4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Elf4Q9Z2U4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Elf4Q9Z2U4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Elf4Q9Z2U4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Elf4Q9Z2U4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Elf4Q9Z2U4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Elf4Q9Z2U4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Elf4Q9Z2U4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Elf4Q9Z2U4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Elf4Q9Z2U4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Elf4Q9Z2U4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Elf4Q9Z2U4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Elf4Q9Z2U4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Elf4Q9Z2U4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Elf4Q9Z2U4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Elf4Q9Z2U4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Elf4Q9Z2U4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Elf4Q9Z2U4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Elf4Q9Z2U4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Elf4Q9Z2U4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Elf4Q9Z2U4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Elf4Q9Z2U4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Elf4Q9Z2U4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Elf4Q9Z2U4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Elf4Q9Z2U4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Elf4Q9Z2U4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Elf4Q9Z2U4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Elf4Q9Z2U4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Elf4Q9Z2U4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Elf4Q9Z2U4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Elf4Q9Z2U4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Elf4Q9Z2U4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Elf4Q9Z2U4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Elf4Q9Z2U4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Elf4Q9Z2U4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Elf4Q9Z2U4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Elf4Q9Z2U4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Elf4Q9Z2U4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Elf4Q9Z2U4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Elf4Q9Z2U4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Elf4Q9Z2U4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Elf4Q9Z2U4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Elf4Q9Z2U4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Elf4Q9Z2U4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Elf4Q9Z2U4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Elf4Q9Z2U4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Elf4Q9Z2U4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Elf4Q9Z2U4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Elf4Q9Z2U4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Elf4Q9Z2U4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Elf4Q9Z2U4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Elf4Q9Z2U4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Elf4Q9Z2U4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Elf4Q9Z2U4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Elf4Q9Z2U4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Elf4Q9Z2U4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Elf4Q9Z2U4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Elf4Q9Z2U4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Elf4Q9Z2U4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Elf4Q9Z2U4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Elf4Q9Z2U4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Elf4Q9Z2U4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Elf4Q9Z2U4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Elf4Q9Z2U4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Elf4Q9Z2U4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Elf4Q9Z2U4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Elf4Q9Z2U4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Elf4Q9Z2U4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Elf4Q9Z2U4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Elf4Q9Z2U4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Elf4Q9Z2U4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Elf4Q9Z2U4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Elf4Q9Z2U4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Elf4Q9Z2U4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Elf4Q9Z2U4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Elf4Q9Z2U4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Elf4Q9Z2U4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Elf4Q9Z2U4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Elf4Q9Z2U4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Elf4Q9Z2U4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Elf4Q9Z2U4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms