Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,88■■■□□ 2,85
Ska1Q9CPV1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,77
Ska1Q9CPV1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Ska1Q9CPV1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Ska1Q9CPV1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,33■■■□□ 2,45
Ska1Q9CPV1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Ska1Q9CPV1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Ska1Q9CPV1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Ska1Q9CPV1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Ska1Q9CPV1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Ska1Q9CPV1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ska1Q9CPV1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,33■■■□□ 2,29
Ska1Q9CPV1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Ska1Q9CPV1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Ska1Q9CPV1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ska1Q9CPV1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Ska1Q9CPV1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,72■■■□□ 2,19
Ska1Q9CPV1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
Ska1Q9CPV1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Ska1Q9CPV1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ska1Q9CPV1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,12
Ska1Q9CPV1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ska1Q9CPV1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Ska1Q9CPV1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,2■■■□□ 2,1
Ska1Q9CPV1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Ska1Q9CPV1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Ska1Q9CPV1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ska1Q9CPV1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Ska1Q9CPV1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Ska1Q9CPV1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ska1Q9CPV1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ska1Q9CPV1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ska1Q9CPV1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Ska1Q9CPV1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ska1Q9CPV1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ska1Q9CPV1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ska1Q9CPV1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,64■■■□□ 2,01
Ska1Q9CPV1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,61■■■□□ 2,01
Ska1Q9CPV1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Ska1Q9CPV1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ska1Q9CPV1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Ska1Q9CPV1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Ska1Q9CPV1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,38■■□□□ 1,97
Ska1Q9CPV1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,96
Ska1Q9CPV1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Ska1Q9CPV1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Ska1Q9CPV1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Ska1Q9CPV1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ska1Q9CPV1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Ska1Q9CPV1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Ska1Q9CPV1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
Ska1Q9CPV1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Ska1Q9CPV1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ska1Q9CPV1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ska1Q9CPV1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ska1Q9CPV1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,91■■□□□ 1,9
Ska1Q9CPV1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ska1Q9CPV1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ska1Q9CPV1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ska1Q9CPV1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ska1Q9CPV1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Ska1Q9CPV1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Ska1Q9CPV1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Ska1Q9CPV1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Ska1Q9CPV1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Ska1Q9CPV1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,54■■□□□ 1,84
Ska1Q9CPV1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Ska1Q9CPV1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Ska1Q9CPV1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Ska1Q9CPV1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Ska1Q9CPV1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Ska1Q9CPV1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Ska1Q9CPV1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Ska1Q9CPV1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Ska1Q9CPV1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Ska1Q9CPV1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Ska1Q9CPV1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Ska1Q9CPV1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Ska1Q9CPV1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Ska1Q9CPV1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Ska1Q9CPV1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Ska1Q9CPV1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Ska1Q9CPV1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Ska1Q9CPV1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Ska1Q9CPV1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Ska1Q9CPV1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Ska1Q9CPV1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Ska1Q9CPV1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ska1Q9CPV1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Ska1Q9CPV1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Ska1Q9CPV1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Ska1Q9CPV1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Ska1Q9CPV1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,8■■□□□ 1,72
Ska1Q9CPV1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Ska1Q9CPV1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Ska1Q9CPV1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Ska1Q9CPV1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Ska1Q9CPV1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,73■■□□□ 1,71
Ska1Q9CPV1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Ska1Q9CPV1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,3 ms