RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Foxj1Q61660 421 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1288Q7TQY0 312 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CpmQ80V42 443 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Commd2Q8BXC6 199 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slitrk6Q8C110 840 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gatad2aQ8CHY6 629 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Akirin1Q99LF1 191 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 2610042L04RikQ9D073 150 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Isca2Q9DCB8 154 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr316A0A0N4SVP2 306 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr620E9PZ66 313 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zscan4bE9Q3G0 505 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20441G3UYJ7 252 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psmd4O35226 376 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd244Q07763 397 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr318Q5NCD7 306 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Efcab3Q80X60 432 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 St7Q99M96 577 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpr45Q9EQQ4 373 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr12Q9JJA4 423 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pin1Q9QUR7 165 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DguokQ9QX60 277 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1306A2BFL7 312 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10800D3Z496 220 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 St3gal5O88829 414 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Anxa2P07356 339 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prdx1P35700 199 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gstm5P48774 224 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FcamrQ2TB54 535 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc2a6Q3UDF0 497 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q5EBG8 199 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 XiapQ60989 496 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Med22Q62276 200 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bhlhb9Q6PB60 539 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DdnQ80TS7 710 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mblac2Q8BL86 279 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hspa13Q8BM72 471 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CptpQ8BS40 216 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gsk3bQ9WV60 420 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ggta1l1A2AUQ7 319 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r75G5E8Z7 853 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20828J3KMI7 228 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fignl2J3QK54 644 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HcrtO55241 130 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mmp11Q02853 492 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpr174Q3U507 335 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ephx3Q3V1F8 367 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Xkr5Q5GH66 676 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clhc1Q5M6W3 596 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5416Q6IE28 97 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rbm11Q80YT9 238 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8BHG2 160 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fmo9Q8C116 539 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem259Q8CIV2 574 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r185Q8R299 319 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r22Q8R2D1 302 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfyve21Q8VCM3 234 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Golm1Q91XA2 393 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Natd1Q9DBW3 110 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adam17Q9Z0F8 827 aa12.43□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pramef6A2A8M8 474 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf382B2RXC5 579 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp949E9Q732 603 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcyt1aP49586 367 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dsc2P55292 902 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CishQ62225 257 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Inppl1Q6P549 1257 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CapslQ6P8Y1 208 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AY358078Q6UY53 465 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr684Q7TRN8 312 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fbxo48Q8CAT8 161 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrif1Q8CDD9 755 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr398Q8VFY0 314 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdh18Q8VHR0 1134 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kat6aQ8BZ21 2003 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc9a5B2RXE2 898 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bbip1J3QMK2 67 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r51L7N215 852 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adamts15P59384 950 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ElocP83940 112 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arf5P84084 180 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Marveld2Q3UZP0 555 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ap4e1Q80V94 1122 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr74Q8VCG3 384 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr347Q8VGK2 312 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zdhhc21Q9D270 265 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tomm20lQ9D4V6 152 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnaja2Q9QYJ0 412 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 B4galt2Q9Z2Y2 369 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Btnl6A2CG22 539 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc28a1E9PXX9 648 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psmb10O35955 273 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01644 108 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01645 108 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01646 108 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01647 108 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SrgnP13609 152 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GhrhrP32082 423 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TtlP38585 377 aa12.42□□□□□ -0.42
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Csnk2bP67871 215 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 54 ms