Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,47■■■■□ 3,59
ElocP83940 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
ElocP83940 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
ElocP83940 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,77■■■□□ 2,84
ElocP83940 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,42■■■□□ 2,78
ElocP83940 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32■■■□□ 2,71
ElocP83940 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
ElocP83940 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
ElocP83940 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
ElocP83940 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
ElocP83940 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
ElocP83940 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,35■■■□□ 2,61
ElocP83940 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
ElocP83940 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,01■■■□□ 2,55
ElocP83940 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
ElocP83940 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
ElocP83940 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,29■■■□□ 2,44
ElocP83940 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,26■■■□□ 2,43
ElocP83940 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,24■■■□□ 2,43
ElocP83940 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
ElocP83940 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
ElocP83940 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,03■■■□□ 2,4
ElocP83940 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,98■■■□□ 2,39
ElocP83940 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
ElocP83940 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
ElocP83940 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
ElocP83940 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
ElocP83940 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
ElocP83940 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
ElocP83940 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
ElocP83940 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,63■■■□□ 2,33
ElocP83940 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
ElocP83940 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
ElocP83940 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,55■■■□□ 2,32
ElocP83940 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
ElocP83940 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
ElocP83940 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
ElocP83940 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,09■■■□□ 2,25
ElocP83940 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,06■■■□□ 2,24
ElocP83940 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
ElocP83940 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,89■■■□□ 2,22
ElocP83940 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
ElocP83940 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
ElocP83940 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
ElocP83940 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,73■■■□□ 2,19
ElocP83940 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
ElocP83940 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,68■■■□□ 2,18
ElocP83940 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
ElocP83940 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
ElocP83940 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
ElocP83940 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
ElocP83940 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
ElocP83940 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
ElocP83940 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
ElocP83940 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,27■■■□□ 2,12
ElocP83940 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
ElocP83940 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
ElocP83940 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
ElocP83940 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
ElocP83940 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
ElocP83940 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
ElocP83940 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
ElocP83940 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
ElocP83940 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
ElocP83940 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
ElocP83940 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,95■■■□□ 2,06
ElocP83940 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
ElocP83940 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,85■■■□□ 2,05
ElocP83940 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
ElocP83940 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,83■■■□□ 2,05
ElocP83940 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,82■■■□□ 2,04
ElocP83940 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
ElocP83940 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
ElocP83940 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
ElocP83940 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
ElocP83940 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
ElocP83940 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
ElocP83940 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
ElocP83940 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
ElocP83940 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,72■■■□□ 2,03
ElocP83940 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,71■■■□□ 2,03
ElocP83940 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
ElocP83940 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,68■■■□□ 2,02
ElocP83940 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
ElocP83940 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
ElocP83940 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
ElocP83940 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
ElocP83940 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
ElocP83940 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
ElocP83940 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
ElocP83940 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
ElocP83940 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
ElocP83940 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
ElocP83940 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,49■■□□□ 1,99
ElocP83940 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
ElocP83940 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
ElocP83940 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,42■■□□□ 1,98
ElocP83940 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,37■■□□□ 1,97
ElocP83940 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
ElocP83940 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
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