Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYJ0

Dnaja2, DnaJ homolog subfamily A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja2Q9QYJ0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Dnaja2Q9QYJ0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Dnaja2Q9QYJ0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Dnaja2Q9QYJ0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Dnaja2Q9QYJ0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Dnaja2Q9QYJ0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Dnaja2Q9QYJ0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Dnaja2Q9QYJ0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Dnaja2Q9QYJ0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Dnaja2Q9QYJ0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Dnaja2Q9QYJ0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Dnaja2Q9QYJ0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Dnaja2Q9QYJ0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Dnaja2Q9QYJ0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Dnaja2Q9QYJ0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Dnaja2Q9QYJ0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Dnaja2Q9QYJ0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Dnaja2Q9QYJ0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Dnaja2Q9QYJ0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Dnaja2Q9QYJ0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dnaja2Q9QYJ0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Dnaja2Q9QYJ0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Dnaja2Q9QYJ0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Dnaja2Q9QYJ0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Dnaja2Q9QYJ0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dnaja2Q9QYJ0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dnaja2Q9QYJ0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dnaja2Q9QYJ0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dnaja2Q9QYJ0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dnaja2Q9QYJ0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dnaja2Q9QYJ0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dnaja2Q9QYJ0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dnaja2Q9QYJ0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Dnaja2Q9QYJ0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Dnaja2Q9QYJ0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dnaja2Q9QYJ0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Dnaja2Q9QYJ0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dnaja2Q9QYJ0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Dnaja2Q9QYJ0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dnaja2Q9QYJ0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dnaja2Q9QYJ0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Dnaja2Q9QYJ0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnaja2Q9QYJ0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnaja2Q9QYJ0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnaja2Q9QYJ0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnaja2Q9QYJ0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dnaja2Q9QYJ0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnaja2Q9QYJ0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dnaja2Q9QYJ0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dnaja2Q9QYJ0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dnaja2Q9QYJ0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Dnaja2Q9QYJ0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dnaja2Q9QYJ0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Dnaja2Q9QYJ0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dnaja2Q9QYJ0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Dnaja2Q9QYJ0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dnaja2Q9QYJ0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Dnaja2Q9QYJ0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Dnaja2Q9QYJ0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnaja2Q9QYJ0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dnaja2Q9QYJ0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Dnaja2Q9QYJ0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dnaja2Q9QYJ0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnaja2Q9QYJ0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnaja2Q9QYJ0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnaja2Q9QYJ0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dnaja2Q9QYJ0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Dnaja2Q9QYJ0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dnaja2Q9QYJ0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dnaja2Q9QYJ0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnaja2Q9QYJ0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dnaja2Q9QYJ0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dnaja2Q9QYJ0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnaja2Q9QYJ0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnaja2Q9QYJ0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnaja2Q9QYJ0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnaja2Q9QYJ0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnaja2Q9QYJ0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnaja2Q9QYJ0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnaja2Q9QYJ0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnaja2Q9QYJ0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dnaja2Q9QYJ0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dnaja2Q9QYJ0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dnaja2Q9QYJ0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnaja2Q9QYJ0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnaja2Q9QYJ0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dnaja2Q9QYJ0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnaja2Q9QYJ0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dnaja2Q9QYJ0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dnaja2Q9QYJ0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnaja2Q9QYJ0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Dnaja2Q9QYJ0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dnaja2Q9QYJ0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dnaja2Q9QYJ0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dnaja2Q9QYJ0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Dnaja2Q9QYJ0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dnaja2Q9QYJ0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dnaja2Q9QYJ0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dnaja2Q9QYJ0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dnaja2Q9QYJ0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms