Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Gm20828J3KMI7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Gm20828J3KMI7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Gm20828J3KMI7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Gm20828J3KMI7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Gm20828J3KMI7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Gm20828J3KMI7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Gm20828J3KMI7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Gm20828J3KMI7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Gm20828J3KMI7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Gm20828J3KMI7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Gm20828J3KMI7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gm20828J3KMI7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
Gm20828J3KMI7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gm20828J3KMI7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gm20828J3KMI7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Gm20828J3KMI7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gm20828J3KMI7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Gm20828J3KMI7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gm20828J3KMI7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gm20828J3KMI7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gm20828J3KMI7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gm20828J3KMI7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Gm20828J3KMI7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Gm20828J3KMI7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Gm20828J3KMI7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gm20828J3KMI7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Gm20828J3KMI7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gm20828J3KMI7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gm20828J3KMI7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gm20828J3KMI7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gm20828J3KMI7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gm20828J3KMI7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gm20828J3KMI7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gm20828J3KMI7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gm20828J3KMI7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gm20828J3KMI7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gm20828J3KMI7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Gm20828J3KMI7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gm20828J3KMI7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gm20828J3KMI7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gm20828J3KMI7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gm20828J3KMI7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gm20828J3KMI7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Gm20828J3KMI7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gm20828J3KMI7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gm20828J3KMI7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Gm20828J3KMI7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gm20828J3KMI7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm20828J3KMI7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Gm20828J3KMI7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm20828J3KMI7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm20828J3KMI7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm20828J3KMI7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm20828J3KMI7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm20828J3KMI7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gm20828J3KMI7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm20828J3KMI7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gm20828J3KMI7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm20828J3KMI7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm20828J3KMI7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm20828J3KMI7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm20828J3KMI7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gm20828J3KMI7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gm20828J3KMI7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Gm20828J3KMI7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm20828J3KMI7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm20828J3KMI7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm20828J3KMI7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Gm20828J3KMI7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gm20828J3KMI7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gm20828J3KMI7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm20828J3KMI7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm20828J3KMI7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm20828J3KMI7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm20828J3KMI7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm20828J3KMI7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm20828J3KMI7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm20828J3KMI7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm20828J3KMI7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm20828J3KMI7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm20828J3KMI7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm20828J3KMI7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gm20828J3KMI7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gm20828J3KMI7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gm20828J3KMI7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gm20828J3KMI7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm20828J3KMI7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm20828J3KMI7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm20828J3KMI7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gm20828J3KMI7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gm20828J3KMI7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gm20828J3KMI7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gm20828J3KMI7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gm20828J3KMI7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm20828J3KMI7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm20828J3KMI7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm20828J3KMI7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm20828J3KMI7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm20828J3KMI7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
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