Protein–RNA interactions for Protein: O88829

St3gal5, Lactosylceramide alpha-2,3-sialyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
St3gal5O88829 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
St3gal5O88829 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
St3gal5O88829 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
St3gal5O88829 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
St3gal5O88829 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
St3gal5O88829 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
St3gal5O88829 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
St3gal5O88829 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
St3gal5O88829 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
St3gal5O88829 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
St3gal5O88829 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
St3gal5O88829 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
St3gal5O88829 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
St3gal5O88829 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
St3gal5O88829 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
St3gal5O88829 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
St3gal5O88829 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
St3gal5O88829 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
St3gal5O88829 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
St3gal5O88829 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
St3gal5O88829 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
St3gal5O88829 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
St3gal5O88829 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
St3gal5O88829 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
St3gal5O88829 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
St3gal5O88829 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
St3gal5O88829 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
St3gal5O88829 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
St3gal5O88829 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
St3gal5O88829 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
St3gal5O88829 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
St3gal5O88829 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
St3gal5O88829 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
St3gal5O88829 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
St3gal5O88829 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
St3gal5O88829 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
St3gal5O88829 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
St3gal5O88829 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
St3gal5O88829 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
St3gal5O88829 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
St3gal5O88829 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
St3gal5O88829 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
St3gal5O88829 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
St3gal5O88829 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
St3gal5O88829 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
St3gal5O88829 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
St3gal5O88829 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
St3gal5O88829 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
St3gal5O88829 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
St3gal5O88829 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
St3gal5O88829 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
St3gal5O88829 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
St3gal5O88829 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
St3gal5O88829 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
St3gal5O88829 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
St3gal5O88829 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
St3gal5O88829 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
St3gal5O88829 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
St3gal5O88829 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
St3gal5O88829 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
St3gal5O88829 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
St3gal5O88829 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
St3gal5O88829 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
St3gal5O88829 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
St3gal5O88829 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
St3gal5O88829 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
St3gal5O88829 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
St3gal5O88829 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
St3gal5O88829 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
St3gal5O88829 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
St3gal5O88829 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
St3gal5O88829 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
St3gal5O88829 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
St3gal5O88829 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
St3gal5O88829 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
St3gal5O88829 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
St3gal5O88829 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
St3gal5O88829 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
St3gal5O88829 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
St3gal5O88829 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
St3gal5O88829 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
St3gal5O88829 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
St3gal5O88829 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
St3gal5O88829 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
St3gal5O88829 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
St3gal5O88829 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
St3gal5O88829 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
St3gal5O88829 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
St3gal5O88829 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
St3gal5O88829 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
St3gal5O88829 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
St3gal5O88829 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
St3gal5O88829 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
St3gal5O88829 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
St3gal5O88829 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
St3gal5O88829 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
St3gal5O88829 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
St3gal5O88829 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
St3gal5O88829 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
St3gal5O88829 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms