RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 TUBG1P23258 451 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PTGIRP43119 386 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PLP2Q04941 152 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 BTBD16Q32M84 506 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 OR2T5Q6IEZ7 315 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PXKQ7Z7A4 578 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 TMPRSS11BQ86T26 416 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 OR2T29Q8NH02 315 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CPT1BQ92523 772 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 COL20A1Q9P218 1284 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 NRCAMQ92823 1304 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 TUBAL3A6NHL2 446 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 AGAP5A6NIR3 686 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 IL1R1P14778 569 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CD40LGP29965 261 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SOX10P56693 466 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CEP97Q8IW35 865 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 MARVELD2Q8N4S9 558 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 UPRTQ96BW1 309 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 MFSD3Q96ES6 412 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 FAM149AA5PLN7 773 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SCNN1GP51170 649 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 GINS1Q14691 196 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 GUK1Q16774 197 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 MED27Q6P2C8 311 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CYP4X1Q8N118 509 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PLD5Q8N7P1 536 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RNF170Q96K19 258 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RCBTB2O95199 551 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ACTR1BP42025 376 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RPIAP49247 311 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CLEC6AQ6EIG7 209 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 GPR153Q6NV75 609 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CPA6Q8N4T0 437 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ARL11Q969Q4 196 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ASPNQ9BXN1 380 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RHBGQ9H310 441 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 FLRT1Q9NZU1 646 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SLC7A8Q9UHI5 535 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CDC14AQ9UNH5 594 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 GMDSO60547 372 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 FAM155BO75949 473 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 NDST3O95803 873 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 HCKP08631 526 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CBSLP0DN79 551 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PKMP14618 531 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CBSP35520 551 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 DEFA6Q01524 100 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 KDELC1Q6UW63 502 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 APOLD1Q96LR9 279 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 COL21A1Q96P44 957 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 NUDT9Q9BW91 350 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RLIMQ9NVW2 624 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 COL1A2P08123 1366 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 MFSD11O43934 449 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 LILRB5O75023 590 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RAC2P15153 192 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 KLRC2P26717 231 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SERPINF1P36955 418 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 BNIP3Q12983 259 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CAPSQ13938 189 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 HGSNATQ68CP4 663 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 BTN2A3PQ96KV6 586 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SPIN2AQ99865 258 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SDCBP2Q9H190 292 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.8□□□□□ -1.32
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