RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 YBX1P67809 324 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 ZNF33BQ06732 778 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 ATP1A4Q13733 1029 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 TSSK4Q6SA08 328 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 C17orf64Q86WR6 236 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 WDR20Q8TBZ3 569 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 EDAQ92838 391 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 REPS1Q96D71 796 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 NPAS2Q99743 824 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 LRTM1Q9HBL6 345 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 S100A14Q9HCY8 104 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 TM9SF3Q9HD45 589 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 TAAR2Q9P1P5 351 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
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THBS3-210ENST00000541576 EML5Q05BV3 1969 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 TLR4O00206 839 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 SEC22BO75396 215 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 CDH1P12830 882 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 JUNDP17535 347 aa8.36□□□□□ -1.07
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THBS3-210ENST00000541576 SOX11P35716 441 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 TLR1Q15399 786 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 SMU1Q2TAY7 513 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 ADNP2Q6IQ32 1131 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 MED27Q6P2C8 311 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 TAF8Q7Z7C8 310 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 OR7G3Q8NG95 312 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 OR2L8Q8NGY9 312 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 NUDT8Q8WV74 236 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 TMIGD2Q96BF3 282 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 BRINP2Q9C0B6 783 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 C1orf109Q9NX04 203 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 ICKQ9UPZ9 632 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 A0A088AWK7 358 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 A0A1W2PPV9 198 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 SERTM1A2A2V5 107 aa8.35□□□□□ -1.07
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THBS3-210ENST00000541576 CDK4P11802 303 aa8.35□□□□□ -1.07
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THBS3-210ENST00000541576 SLC19A1P41440 591 aa8.35□□□□□ -1.07
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THBS3-210ENST00000541576 LAPTM5Q13571 262 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 ANKDD1AQ495B1 522 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 DNAL1Q4LDG9 190 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 IL23RQ5VWK5 629 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 PDSS2Q86YH6 399 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 FAM156AQ8NDB6 213 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 LCN9Q8WX39 176 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 PIPSLA2A3N6 862 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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THBS3-210ENST00000541576 G6PDP11413 515 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 IL12AP29459 219 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 MAGEA8P43361 318 aa8.35□□□□□ -1.07
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THBS3-210ENST00000541576 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 C1orf61Q13536 156 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 WDR45BQ5MNZ6 344 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 ZFAND4Q86XD8 727 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 DSELQ8IZU8 1212 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 METTL25Q8N6Q8 603 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 UBE2E3Q969T4 207 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 SLC25A23Q9BV35 468 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 LRRC61Q9BV99 259 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 ACTL8Q9H568 366 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 SLC52A3Q9NQ40 469 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 NPIPB8E9PQR5 432 aa8.35□□□□□ -1.07
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