RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516162.1

RNU6-1333P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1333, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1333P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1333P-201ENST00000516162 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF233A6NK53 670 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PHGR1C9JFL3 82 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RNF103O00237 685 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DLGAP1O14490 977 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OGG1O15527 345 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HCRTR2O43614 444 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NMBRP28336 390 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RIPPLY3P57055 190 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CXCL6P80162 114 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC12A1Q13621 1099 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMEM266Q2M3C6 531 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BBS12Q6ZW61 710 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPICE1Q8N0Z3 855 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MOSPD2Q8NHP6 518 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FUZQ9BT04 418 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM167BQ9BTA0 163 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SALL1Q9NSC2 1324 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OSER1Q9NX31 292 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 R4GN57 208 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP-0□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCT8L1PA6NM43 557 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 E2F3O00716 465 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PAGE4O60829 102 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 UFL1O94874 794 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGHG1P01857 330 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCNE1P24864 410 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPR183P32249 361 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPRP35270 261 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BRCC3P46736 316 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NDST1P52848 882 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PPP2R2BQ00005 443 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF415Q09FC8 603 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MELKQ14680 651 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCDC38Q502W7 563 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC22A15Q8IZD6 547 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR9Q2Q8NGE9 314 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR5M8Q8NGP6 311 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MARCH1Q8TCQ1 289 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCT8L2Q96SF2 557 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DNAI2Q9GZS0 605 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C10orf88Q9H8K7 445 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NLRC4Q9NPP4 1024 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KLK11Q9UBX7 282 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AMACRQ9UHK6 382 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRDM4Q9UKN5 801 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SARDHQ9UL12 918 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 WSB1Q9Y6I7 421 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A0A1W2PPK0 400 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 J3QKU1 62 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TSPAN4O14817 238 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ATP1B1P05026 303 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RPA1P27694 616 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF136P52737 540 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LMOD3Q0VAK6 560 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CDC73Q6P1J9 531 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 THAP8Q8NA92 274 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SAAL1Q96ER3 474 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PAGR1Q9BTK6 254 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CRB3Q9BUF7 120 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HPS4Q9NQG7 708 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GKN1Q9NS71 199 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KLRF1Q9NZS2 232 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CAMK2AQ9UQM7 478 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCDC189A1A4V9 331 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF487B1APH4 448 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TNFSF12O43508 249 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TNFSF14O43557 240 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SSX4O60224 188 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NDUFS3O75489 264 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRPC1P48995 793 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EIF5P55010 431 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PAX5Q02548 391 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms