RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 ACSL4O60488 711 aa7.06□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 IGHV4-31P0DP07 118 aa7.06□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 FGF5P12034 268 aa7.06□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 NR2C2P49116 596 aa7.06□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 FMO5P49326 533 aa7.06□□□□□ -1.28
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PGGT1B-205ENST00000514178 HERC3Q15034 1050 aa7.06□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.06□□□□□ -1.28
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PGGT1B-205ENST00000514178 PPP1R3DO95685 299 aa7.05□□□□□ -1.28
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PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF132P52740 706 aa7.05□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
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PGGT1B-205ENST00000514178 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa7.05□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.05□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 ARMC9Q7Z3E5 817 aa7.05□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 LAX1Q8IWV1 398 aa7.05□□□□□ -1.28
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PGGT1B-205ENST00000514178 C10orf88Q9H8K7 445 aa7.05□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 ACTR3BQ9P1U1 418 aa7.05□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 EPS15L1Q9UBC2 864 aa7.05□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
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PGGT1B-205ENST00000514178 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa7.04□□□□□ -1.28
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PGGT1B-205ENST00000514178 DESP17661 470 aa7.04□□□□□ -1.28
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PGGT1B-205ENST00000514178 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
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PGGT1B-205ENST00000514178 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa7.04□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 RFT1Q96AA3 541 aa7.04□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.04□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 PKP2Q99959 881 aa7.04□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF121Q9H920 327 aa7.04□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
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PGGT1B-205ENST00000514178 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa7.03□□□□□ -1.28
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PGGT1B-205ENST00000514178 E5RGE8 158 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 H3BMM5 538 aa7.03□□□□□ -1.28
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PGGT1B-205ENST00000514178 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
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PGGT1B-205ENST00000514178 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 OPCMLQ14982 345 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 C9orf57Q5W0N0 161 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 AWAT2Q6E213 333 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 BTN2A1Q7KYR7 527 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 PRUNE1Q86TP1 453 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 BATF2Q8N1L9 274 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 KBTBD3Q8NAB2 608 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 CNNM3Q8NE01 707 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
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