RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486261.5

KRIT1-222, Transcript of KRIT1, ankyrin repeat containing, human

TSL 1 (best)

Gene KRIT1, Length 4,057 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRIT1-222	ENST00000486261	TCN2	P20062	427 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	TGM1	P22735	817 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	FDFT1	P37268	417 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	SPAM1	P38567	509 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	CCR10	P46092	362 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	GIPR	P48546	466 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	ACADVL	P49748	655 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	JAM2	P57087	298 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	PRAME	P78395	509 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	C1orf61	Q13536	156 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	RUNX2	Q13950	521 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	RTP5	Q14D33	572 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.69	□□□□□ -1.66	5e-6	■■■□□ 18.7
KRIT1-222	ENST00000486261	CT83	Q5H943	113 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	LZIC	Q8WZA0	190 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	PEX13	Q92968	403 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	MVB12A	Q96EY5	273 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	SCRN2	Q96FV2	425 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	KLC2	Q9H0B6	622 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	VWA8	A3KMH1	1905 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	SYCE1L	A8MT33	242 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	STX16	O14662	325 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	GRID2	O43424	1007 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	TFPT	P0C1Z6	253 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	AHCY	P23526	432 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	CASP14	P31944	242 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	SERPINB8	P50452	374 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	CAPZA1	P52907	286 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	EPHA4	P54764	986 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	CLDN2	P57739	230 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	RAB14	P61106	215 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	CXADR	P78310	365 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	ZXDB	P98169	803 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	C2orf54	Q08AI8	447 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	IRF4	Q15306	451 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	ISX	Q2M1V0	245 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	SPATA24	Q86W54	205 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	FAM129C	Q86XR2	697 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	JADE3	Q92613	823 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	PANX3	Q96QZ0	392 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	CLPB	Q9H078	707 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	CTDSP2	O14595	271 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	DNAJB5	O75953	348 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	TUBB4A	P04350	444 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	IL10	P22301	178 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	DNASE1	P24855	282 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	GCGR	P47871	477 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	PPP2CB	P62714	309 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	PPP2CA	P67775	309 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	BNIP3	Q12983	259 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	INPP5A	Q14642	412 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	NR1D2	Q14995	579 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	RPS6KA1	Q15418	735 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	LIPI	Q6XZB0	460 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	KCTD9	Q7L273	389 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	SPRED1	Q7Z699	444 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	RETREG3	Q86VR2	466 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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