RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 BSGP35613 385 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 CCR8P51685 355 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 DIO3P55073 304 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 NAE1Q13564 534 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 CCNIQ14094 377 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 ZFP1Q6P2D0 407 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 GK5Q6ZS86 529 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 Q6ZSR6 202 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 TICAM1Q8IUC6 712 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 AQP12AQ8IXF9 295 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 FAM136AQ96C01 138 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 TUBGCP3Q96CW5 907 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 RCN3Q96D15 328 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 SPDL1Q96EA4 605 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 CDK15Q96Q40 435 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 DCLRE1BQ9H816 532 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 WDR41Q9HAD4 459 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 C2orf42Q9NWW7 574 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 EPHA6Q9UF33 1036 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.2□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 H3BNX3 289 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 YKT6O15498 198 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 SEMG1P04279 462 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 G6PDP11413 515 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 SLC6A2P23975 617 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 CNR2P34972 360 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 PGM1P36871 562 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 GABRA4P48169 554 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 NOXRED1Q6NXP6 359 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 HID1Q8IV36 788 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 MSRB3Q8IXL7 192 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 SNX31Q8N9S9 440 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 OR2L3Q8NG85 312 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 OR13H1Q8NG92 308 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 HUS1BQ8NHY5 278 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 EDAQ92838 391 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 EXT2Q93063 718 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 LRRC58Q96CX6 371 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 AICDAQ9GZX7 198 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 ACTR8Q9H981 624 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 ACSS2Q9NR19 701 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 TBC1D29Q9UFV1 150 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 POMPQ9Y244 141 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 BTRCQ9Y297 605 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 FAM170BA6NMN3 283 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 PSME3P61289 254 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 UFM1P61960 85 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 IRF8Q02556 426 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 CEACAM7Q14002 265 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 WLSQ5T9L3 541 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 CPZQ66K79 652 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 SLC9B2Q86UD5 537 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 OR2A14Q96R47 310 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 CROTQ9UKG9 612 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 BLACEA4D250 179 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 PRSS23O95084 383 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 ETHE1O95571 254 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 ONECUT2O95948 504 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 TSPAN8P19075 237 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 XKR6Q5GH73 641 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 DEPDC1Q5TB30 811 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC80Q76M96 950 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 SERPINA11Q86U17 422 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 PAF1Q8N7H5 531 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 GPR156Q8NFN8 814 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 ESAMQ96AP7 390 aa6.19□□□□□ -1.42
PRKCI-202ENST00000476635 APIPQ96GX9 242 aa6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms