RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000032487.13

Vamp1-201, Transcript of Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vamp1, Length 2,772 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Myl12bQ3THE2 172 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tamm41Q3TUH1 337 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Q3TYS2 187 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Etaa1Q5SVT3 877 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Myl12aQ6ZWQ9 172 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 RinlQ80UW3 563 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Bend7Q8BSV3 434 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Smyd4Q8BTK5 799 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pdlim5Q8CI51 591 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mrpl48Q8JZS9 211 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Hbp1Q8R316 516 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 PxnQ8VI36 591 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Lims2Q91XD2 341 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rwdd2bQ99M03 290 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Raf1Q99N57 648 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pmf1Q9CPV5 202 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Det1Q9D0A0 550 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cst11Q9D269 139 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Glod5Q9D8I3 148 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm3526E9PZM0 191 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 H2-T24F8VQG4 363 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Angpt1O08538 498 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 RngttO55236 597 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cacng2O88602 323 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 AldocP05063 363 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Htr5bP31387 370 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 GlaP51569 419 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Efna1P52793 205 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Acsm3Q3UNX5 580 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Q6GQU0 248 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tnpo3Q6P2B1 923 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 EnkurQ6SP97 255 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Naaladl1Q7M758 745 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Igsf5Q7TSN7 370 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Dnajc16Q80TN4 772 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pcid2Q8BFV2 399 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 FicdQ8BIX9 458 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Wdr47Q8CGF6 920 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mab21L3Q8CI17 429 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vmn1r191Q8K4D0 298 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vmn1r200Q8R281 312 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Lsm1Q8VC85 133 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rnf130Q8VEM1 419 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr820Q8VFU5 312 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zfp65Q91W94 390 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Elovl6Q920L5 267 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cdca3Q99M54 266 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 ArhgdiaQ99PT1 204 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Hspb11Q9D6H2 143 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ten1Q9D7K2 161 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rhox2dW4VSN9 191 aa11.3□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sult2a7A0A1B0GRF0 313 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 A0A286YD17 136 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Klhdc7bA0A286YD60 1263 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr1153A2AVC0 318 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 A930018M24RikB7ZMY3 218 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Aldh3b2E9Q3E1 479 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tmem44E9Q4M0 433 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Plekha5E9Q6H8 1269 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vmn2r100E9QAZ9 850 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Stam2O88811 523 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cd1d1P11609 336 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cd1d2P11610 336 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gjb3P28231 270 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sox2P48432 319 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sult1e1P49891 295 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 AcadlP51174 430 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 CrxosQ3UL53 246 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Aldh16a1Q571I9 802 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mfsd3Q5U419 412 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm5416Q6IE28 97 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Krba1Q6NXZ1 1043 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pik3ip1Q7TMJ8 264 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Znf516Q7TSH3 1157 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zdhhc17Q80TN5 632 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Wipi2Q80W47 445 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Luzp2Q8BGY3 345 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 BC024139Q8BVJ3 772 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Apoa5Q8C7G5 368 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc22a12Q8CFZ5 553 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 PolbQ8K409 335 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pcdhac1Q91Y10 964 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Glyr1Q922P9 546 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ppp1r16aQ923M0 524 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Dok4Q99KE3 325 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Osbpl3Q9DBS9 855 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 ClpxQ9JHS4 634 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Msgn1Q9JK54 188 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vnn3Q9QZ25 500 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Trbc2A0A075B5J4 173 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 1700031M16RikA0A087WSH0 82 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Trbc1A0A0A6YWV4 173 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ino80eA0A0U1RP99 260 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 2010300C02RikE9Q3M9 1175 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Znf683I7HJS4 458 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Efna5O08543 228 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Angpt2O35608 496 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Hsd17b7O88736 334 aa11.29□□□□□ -0.6
Vamp1-201ENSMUST00000032487 P01664 111 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.5 ms