Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Vmn1r200Q8R281 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Vmn1r200Q8R281 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Vmn1r200Q8R281 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Vmn1r200Q8R281 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Vmn1r200Q8R281 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Vmn1r200Q8R281 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Vmn1r200Q8R281 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Vmn1r200Q8R281 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Vmn1r200Q8R281 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Vmn1r200Q8R281 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Vmn1r200Q8R281 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vmn1r200Q8R281 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Vmn1r200Q8R281 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Vmn1r200Q8R281 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Vmn1r200Q8R281 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vmn1r200Q8R281 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Vmn1r200Q8R281 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vmn1r200Q8R281 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Vmn1r200Q8R281 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vmn1r200Q8R281 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vmn1r200Q8R281 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vmn1r200Q8R281 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Vmn1r200Q8R281 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vmn1r200Q8R281 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vmn1r200Q8R281 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vmn1r200Q8R281 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Vmn1r200Q8R281 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vmn1r200Q8R281 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Vmn1r200Q8R281 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vmn1r200Q8R281 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vmn1r200Q8R281 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vmn1r200Q8R281 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vmn1r200Q8R281 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vmn1r200Q8R281 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vmn1r200Q8R281 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vmn1r200Q8R281 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vmn1r200Q8R281 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vmn1r200Q8R281 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vmn1r200Q8R281 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vmn1r200Q8R281 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vmn1r200Q8R281 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vmn1r200Q8R281 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vmn1r200Q8R281 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vmn1r200Q8R281 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Vmn1r200Q8R281 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vmn1r200Q8R281 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vmn1r200Q8R281 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vmn1r200Q8R281 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vmn1r200Q8R281 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Vmn1r200Q8R281 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vmn1r200Q8R281 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Vmn1r200Q8R281 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vmn1r200Q8R281 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vmn1r200Q8R281 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vmn1r200Q8R281 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Vmn1r200Q8R281 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vmn1r200Q8R281 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vmn1r200Q8R281 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vmn1r200Q8R281 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vmn1r200Q8R281 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vmn1r200Q8R281 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vmn1r200Q8R281 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vmn1r200Q8R281 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vmn1r200Q8R281 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vmn1r200Q8R281 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vmn1r200Q8R281 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vmn1r200Q8R281 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vmn1r200Q8R281 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vmn1r200Q8R281 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vmn1r200Q8R281 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vmn1r200Q8R281 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vmn1r200Q8R281 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Vmn1r200Q8R281 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vmn1r200Q8R281 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vmn1r200Q8R281 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vmn1r200Q8R281 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vmn1r200Q8R281 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Vmn1r200Q8R281 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Vmn1r200Q8R281 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vmn1r200Q8R281 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vmn1r200Q8R281 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vmn1r200Q8R281 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vmn1r200Q8R281 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vmn1r200Q8R281 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vmn1r200Q8R281 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Vmn1r200Q8R281 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vmn1r200Q8R281 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vmn1r200Q8R281 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vmn1r200Q8R281 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vmn1r200Q8R281 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vmn1r200Q8R281 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vmn1r200Q8R281 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vmn1r200Q8R281 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vmn1r200Q8R281 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vmn1r200Q8R281 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vmn1r200Q8R281 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Vmn1r200Q8R281 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vmn1r200Q8R281 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
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