Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
Efna5O08543 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Efna5O08543 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Efna5O08543 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Efna5O08543 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Efna5O08543 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Efna5O08543 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Efna5O08543 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Efna5O08543 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Efna5O08543 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Efna5O08543 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Efna5O08543 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Efna5O08543 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Efna5O08543 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Efna5O08543 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Efna5O08543 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Efna5O08543 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Efna5O08543 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Efna5O08543 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Efna5O08543 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Efna5O08543 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Efna5O08543 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Efna5O08543 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Efna5O08543 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Efna5O08543 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Efna5O08543 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Efna5O08543 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Efna5O08543 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Efna5O08543 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Efna5O08543 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Efna5O08543 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Efna5O08543 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Efna5O08543 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Efna5O08543 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Efna5O08543 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Efna5O08543 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Efna5O08543 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Efna5O08543 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Efna5O08543 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Efna5O08543 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Efna5O08543 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Efna5O08543 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Efna5O08543 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Efna5O08543 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Efna5O08543 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Efna5O08543 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Efna5O08543 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Efna5O08543 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Efna5O08543 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Efna5O08543 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Efna5O08543 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Efna5O08543 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Efna5O08543 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Efna5O08543 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Efna5O08543 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Efna5O08543 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Efna5O08543 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Efna5O08543 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Efna5O08543 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Efna5O08543 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Efna5O08543 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Efna5O08543 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Efna5O08543 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Efna5O08543 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Efna5O08543 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Efna5O08543 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Efna5O08543 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Efna5O08543 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Efna5O08543 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Efna5O08543 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Efna5O08543 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Efna5O08543 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Efna5O08543 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Efna5O08543 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Efna5O08543 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Efna5O08543 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Efna5O08543 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Efna5O08543 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Efna5O08543 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Efna5O08543 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Efna5O08543 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Efna5O08543 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Efna5O08543 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Efna5O08543 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Efna5O08543 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Efna5O08543 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Efna5O08543 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Efna5O08543 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Efna5O08543 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Efna5O08543 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Efna5O08543 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Efna5O08543 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Efna5O08543 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Efna5O08543 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Efna5O08543 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Efna5O08543 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Efna5O08543 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Efna5O08543 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Efna5O08543 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Efna5O08543 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms