Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.03■■■■■ 4
Gjb3P28231 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Gjb3P28231 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Gjb3P28231 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Gjb3P28231 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Gjb3P28231 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Gjb3P28231 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Gjb3P28231 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Gjb3P28231 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Gjb3P28231 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Gjb3P28231 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Gjb3P28231 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Gjb3P28231 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Gjb3P28231 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gjb3P28231 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Gjb3P28231 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Gjb3P28231 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Gjb3P28231 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Gjb3P28231 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Gjb3P28231 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Gjb3P28231 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Gjb3P28231 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Gjb3P28231 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Gjb3P28231 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Gjb3P28231 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Gjb3P28231 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Gjb3P28231 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Gjb3P28231 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Gjb3P28231 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Gjb3P28231 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gjb3P28231 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Gjb3P28231 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Gjb3P28231 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Gjb3P28231 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Gjb3P28231 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Gjb3P28231 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Gjb3P28231 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Gjb3P28231 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Gjb3P28231 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Gjb3P28231 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Gjb3P28231 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Gjb3P28231 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Gjb3P28231 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Gjb3P28231 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Gjb3P28231 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Gjb3P28231 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gjb3P28231 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gjb3P28231 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Gjb3P28231 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gjb3P28231 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gjb3P28231 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gjb3P28231 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gjb3P28231 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Gjb3P28231 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Gjb3P28231 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Gjb3P28231 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Gjb3P28231 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Gjb3P28231 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Gjb3P28231 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Gjb3P28231 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gjb3P28231 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Gjb3P28231 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gjb3P28231 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gjb3P28231 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gjb3P28231 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gjb3P28231 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Gjb3P28231 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gjb3P28231 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gjb3P28231 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Gjb3P28231 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gjb3P28231 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gjb3P28231 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gjb3P28231 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gjb3P28231 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Gjb3P28231 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Gjb3P28231 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gjb3P28231 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Gjb3P28231 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gjb3P28231 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gjb3P28231 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Gjb3P28231 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Gjb3P28231 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gjb3P28231 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gjb3P28231 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gjb3P28231 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Gjb3P28231 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gjb3P28231 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gjb3P28231 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gjb3P28231 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gjb3P28231 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gjb3P28231 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gjb3P28231 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gjb3P28231 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gjb3P28231 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gjb3P28231 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gjb3P28231 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gjb3P28231 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gjb3P28231 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gjb3P28231 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gjb3P28231 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms