Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J4

Trbc2, T cell receptor beta, constant 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbc2A0A075B5J4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Trbc2A0A075B5J4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Trbc2A0A075B5J4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Trbc2A0A075B5J4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Trbc2A0A075B5J4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Trbc2A0A075B5J4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trbc2A0A075B5J4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Trbc2A0A075B5J4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Trbc2A0A075B5J4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trbc2A0A075B5J4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Trbc2A0A075B5J4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trbc2A0A075B5J4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trbc2A0A075B5J4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Trbc2A0A075B5J4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trbc2A0A075B5J4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trbc2A0A075B5J4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trbc2A0A075B5J4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Trbc2A0A075B5J4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trbc2A0A075B5J4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trbc2A0A075B5J4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trbc2A0A075B5J4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trbc2A0A075B5J4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Trbc2A0A075B5J4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trbc2A0A075B5J4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trbc2A0A075B5J4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trbc2A0A075B5J4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trbc2A0A075B5J4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trbc2A0A075B5J4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trbc2A0A075B5J4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Trbc2A0A075B5J4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Trbc2A0A075B5J4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trbc2A0A075B5J4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trbc2A0A075B5J4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trbc2A0A075B5J4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trbc2A0A075B5J4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trbc2A0A075B5J4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trbc2A0A075B5J4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trbc2A0A075B5J4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trbc2A0A075B5J4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trbc2A0A075B5J4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trbc2A0A075B5J4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Trbc2A0A075B5J4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trbc2A0A075B5J4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trbc2A0A075B5J4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trbc2A0A075B5J4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trbc2A0A075B5J4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trbc2A0A075B5J4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trbc2A0A075B5J4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trbc2A0A075B5J4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trbc2A0A075B5J4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trbc2A0A075B5J4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trbc2A0A075B5J4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Trbc2A0A075B5J4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trbc2A0A075B5J4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trbc2A0A075B5J4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trbc2A0A075B5J4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trbc2A0A075B5J4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trbc2A0A075B5J4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trbc2A0A075B5J4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trbc2A0A075B5J4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trbc2A0A075B5J4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trbc2A0A075B5J4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trbc2A0A075B5J4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trbc2A0A075B5J4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trbc2A0A075B5J4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trbc2A0A075B5J4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trbc2A0A075B5J4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Trbc2A0A075B5J4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trbc2A0A075B5J4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trbc2A0A075B5J4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trbc2A0A075B5J4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trbc2A0A075B5J4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trbc2A0A075B5J4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trbc2A0A075B5J4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trbc2A0A075B5J4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trbc2A0A075B5J4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Trbc2A0A075B5J4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trbc2A0A075B5J4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trbc2A0A075B5J4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Trbc2A0A075B5J4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trbc2A0A075B5J4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trbc2A0A075B5J4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Trbc2A0A075B5J4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trbc2A0A075B5J4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trbc2A0A075B5J4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trbc2A0A075B5J4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Trbc2A0A075B5J4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trbc2A0A075B5J4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trbc2A0A075B5J4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trbc2A0A075B5J4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trbc2A0A075B5J4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trbc2A0A075B5J4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trbc2A0A075B5J4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trbc2A0A075B5J4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trbc2A0A075B5J4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trbc2A0A075B5J4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Trbc2A0A075B5J4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trbc2A0A075B5J4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trbc2A0A075B5J4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trbc2A0A075B5J4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms