RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 OTX2P32243 289 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 CASRP41180 1078 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 CSRP3P50461 194 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 PGDP52209 483 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP1A4Q13733 1029 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC9A5Q14940 896 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 NKG7Q16617 165 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM69BQ5VUD6 431 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 AGTRAPQ6RW13 159 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADCK2Q7Z695 626 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 CSNK1A1LQ8N752 337 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 THAP11Q96EK4 314 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 VPS50Q96JG6 964 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 CABS1Q96KC9 395 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR2A5Q96R48 311 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 OLFM1Q99784 485 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC25A23Q9BV35 468 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 SGPP1Q9BX95 441 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM129AQ9BZQ8 928 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 RHOJQ9H4E5 214 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 POPDC3Q9HBV1 291 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF304Q9HCX3 659 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 SAYSD1Q9NPB0 183 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARL15Q9NXU5 204 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDC23Q9UJX2 597 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSAT1Q9Y617 370 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa16.31■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL12A1Q99715 3063 aa16.31■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa16.31■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa16.31■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 UMODP07911 640 aa16.31■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 MMP11P24347 488 aa16.31■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCL11P51671 97 aa16.31■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHKG1Q16816 387 aa16.31■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 COX15Q7KZN9 410 aa16.31■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 C17orf64Q86WR6 236 aa16.31■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 TEX19Q8NA77 164 aa16.31■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLEC1AQ8NC01 280 aa16.31■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 HAUS8Q9BT25 410 aa16.31■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 TXNDC16Q9P2K2 825 aa16.31■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 HAT1O14929 419 aa16.3■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 OCA2Q04671 838 aa16.3■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHAF1BQ13112 559 aa16.3■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 NAE1Q13564 534 aa16.3■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 DSG2Q14126 1118 aa16.3■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 NDUFA9Q16795 377 aa16.3■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 LCTLQ6UWM7 567 aa16.3■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPNS2Q8IVW8 549 aa16.3■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXL8Q96CD0 374 aa16.3■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 C10orf90Q96M02 699 aa16.3■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPSB2Q99619 263 aa16.3■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 MCMBPQ9BTE3 642 aa16.3■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEMA3GQ9NS98 782 aa16.3■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCF3Q9NUQ8 709 aa16.3■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 P4HTMQ9NXG6 502 aa16.3■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa16.3■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 VSTM2BA6NLU5 285 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 H7BY64 318 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 AGPSO00116 658 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 TUBB4AP04350 444 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBLP22087 321 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 GRK3P35626 688 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR1D4P47884 311 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC12A2P55011 1212 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLTPP55058 493 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 SOX8P57073 446 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 POU4F1Q01851 419 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM53BQ14153 422 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCAF10Q5QP82 559 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR56A3Q8NH54 315 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXO25Q8TCJ0 367 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSPAN17Q96FV3 270 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRAP1Q96NZ9 151 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 CPNE1Q99829 537 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 DRC3Q9H069 523 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATG10Q9H0Y0 220 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPR83Q9NYM4 423 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTSFQ9UBX1 484 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD12Q6UB98 2062 aa16.29■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa16.28■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 K7EM74 188 aa16.28■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDH17O14917 1159 aa16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms