RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 ACPPP15309 386 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 ERICH5Q6P6B1 374 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 CBLL1Q75N03 491 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 SVOPQ8N4V2 548 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 OR2AP1Q8NGE2 309 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 LGALS12Q96DT0 336 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 ATG10Q9H0Y0 220 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 REEP1Q9H902 201 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 MICAL3Q7RTP6 2002 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 KRT20P35900 424 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 RXRGP48443 463 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 RPP38P78345 283 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 CD300CQ08708 224 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 CHIT1Q13231 466 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 PROX2Q3B8N5 592 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 PRSS48Q7RTY5 328 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 VOPP1Q96AW1 172 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 DNAJC11Q9NVH1 559 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 SCN8AQ9UQD0 1980 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 BNIP3LO60238 219 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 NUAK1O60285 661 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 TM4SF4P48230 202 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 MVKQ03426 396 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 CLECL1Q8IZS7 167 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 ITPKCQ96DU7 683 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 SIRT5Q9NXA8 310 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 THSD7BQ9C0I4 1608 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 PCDHGA12O60330 932 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 COX7A2P14406 83 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 LMAN2Q12907 356 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 NPRL3Q12980 569 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 ABCB8Q9NUT2 735 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 WBP4O75554 376 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 LHCGRP22888 699 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 OR8J2Q8NGG1 315 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 TPD52L3Q96J77 140 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 PCDH12Q9NPG4 1184 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 SERTM1A2A2V5 107 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 GFYI3L273 518 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 YY2O15391 372 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 JUPP14923 745 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 CREMQ03060 361 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 PLEKHG6Q3KR16 790 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 FAHD1Q6P587 224 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 PRRG1O14668 218 aa26.2■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 CD70P32970 193 aa26.2■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 GRK3P35626 688 aa26.2■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 AHSA2Q719I0 299 aa26.2■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 FCRL1Q96LA6 429 aa26.2■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 BTBD2Q9BX70 525 aa26.2■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 BBS2Q9BXC9 721 aa26.2■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 TPT1P8Q9HAU6 139 aa26.2■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 VPS29Q9UBQ0 182 aa26.2■■□□□ 1.79
SH3BP2-221ENST00000511747 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 ZBBXA8MT70 800 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 LCKP06239 509 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 LAMP1P11279 417 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 CD36P16671 472 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 ITGA1P56199 1179 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 PFN3P60673 137 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 DNASE1L3Q13609 305 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 IQCCQ4KMZ1 466 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 TPGS2Q68CL5 300 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 USP45Q70EL2 814 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 GPR155Q7Z3F1 870 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 CDC26Q8NHZ8 85 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 IGSF21Q96ID5 467 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 BTBD3Q9Y2F9 522 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 PRMT3O60678 531 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 TGM1P22735 817 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 TGFBR1P36897 503 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 STK19P49842 368 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 VEZF1Q14119 521 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 SF1Q15637 639 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 PAGE2Q7Z2X7 111 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 OR2A25A4D2G3 310 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 NUDT7P0C024 238 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 CD22P20273 847 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-221ENST00000511747 CYP2A7P20853 494 aa26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms