RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	KRT222	Q8N1A0	295 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	ELMO1	Q92556	727 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	CDKL2	Q92772	493 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	PANX3	Q96QZ0	392 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	FUT8	Q9BYC5	575 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	RUBCNL	Q9H714	662 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	COG4	Q9H9E3	785 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	POT1	Q9NUX5	634 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	MED16	Q9Y2X0	877 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		13.27	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	NIPSNAP2	O75323	286 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ACSL3	O95573	720 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	EDN3	P14138	238 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	AOAH	P28039	575 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	PHB	P35232	272 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	KIR3DL1	P43629	444 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CD151	P48509	253 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CDC16	Q13042	620 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	MLIP	Q5VWP3	458 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CDH24	Q86UP0	819 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	AMER2	Q8N7J2	671 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	KCNJ9	Q92806	393 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	KPNA5	O15131	536 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	HCRTR1	O43613	425 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	GPC4	O75487	556 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	JRK	O75564	520 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	SLCO2B1	O94956	709 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CBSL	P0DN79	551 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CHRM3	P20309	590 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	PDHA2	P29803	388 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	PTGER4	P35408	488 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CBS	P35520	551 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	PREP	P48147	710 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CLCN7	P51798	805 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	NAB1	Q13506	487 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	BRD3	Q15059	726 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CYTH2	Q99418	400 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CPNE1	Q99829	537 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	RAB33B	Q9H082	229 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	WWP1	Q9H0M0	922 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CDYL	Q9Y232	598 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222		A0A1B0GUH1	482 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	OR6C74	A6NCV1	312 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	OR5K3	A6NET4	321 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222		E5RI56	91 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	RIPK2	O43353	540 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	APOA4	P06727	396 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ABHD2	P08910	425 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	PVR	P15151	417 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CD9	P21926	228 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	MCM3	P25205	808 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	GP5	P40197	560 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	HAL	P42357	657 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		13.25	□□□□□ -0.29

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