RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047273.1

Rpusd1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rpusd1, Length 1,703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Tmcc1Q69ZZ6 649 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Rasgrp3Q6NZH9 691 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Zmiz1Q6P1E1 1072 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Med16Q6PGF3 828 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Zpbp2Q6X786 326 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Rslcan18Q7M6X5 460 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Trim50Q810I2 483 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Nudt13Q8JZU0 352 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Nudcd3Q8R1N4 363 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Ankrd49Q8VE42 238 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Cdkal1Q91WE6 578 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Depdc7Q91WS7 511 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 LsrQ99KG5 594 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Cryl1Q99KP3 319 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 NgrnQ99KS2 293 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Fam90a1bQ9D4F3 419 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Tmem81Q9D5K1 259 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Prss23Q9D6X6 382 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Clca1Q9D7Z6 913 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Glod5Q9D8I3 148 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Dennd6bQ9D9V7 585 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Atp5oQ9DB20 213 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Ca7Q9ERQ8 264 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 C1qtnf3Q9ES30 246 aa8.4□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Gm43796A0A0J9YV32 372 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 6330409D20RikA2AK85 162 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 FpgtG5E8F4 590 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Rgsl1H3BL40 1073 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 A630095N17RikJ3KMM7 116 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Kcnk4O88454 398 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Prl3b1P09586 222 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Sbk2P0C5K1 362 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 BpgmP15327 259 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Chrm4P32211 479 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Cdx2P43241 311 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Impdh1P50096 514 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 BckdhaP50136 442 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 NficP70255 439 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Cpt1aP97742 773 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Glycam1Q02596 151 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 ptchd1Q14B62 888 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Kcnc2Q14B80 642 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Slc10a7Q5PT53 340 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 JrkQ60976 557 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Gstt2Q61133 244 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Pcbp2Q61990 362 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Ift52Q62559 426 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 OmpQ64288 163 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Tnpo3Q6P2B1 923 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Dennd2cQ6P9P8 914 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 PrlhrQ6VMN6 370 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Ssxb5Q6XAS2 159 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Scn4bQ7M729 228 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 PdprQ7TSQ8 878 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Avl9Q80U56 649 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Znf32Q80V23 272 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 GgnQ80WJ1 673 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Slitrk4Q810B8 837 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Q8BGA7 448 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 GanabQ8BHN3 944 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Eme1Q8BJW7 570 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Fam124bQ8BLQ0 456 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Lrfn3Q8BLY3 626 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 PstkQ8BP74 359 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Prkaa2Q8BRK8 552 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Ston2Q8BZ60 895 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Stk-ps2Q8C0V7 499 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Trnt1Q8K1J6 434 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Cdc16Q8R349 620 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Mgat5Q8R4G6 740 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Stx18Q8VDS8 334 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Olfr315Q8VFG7 309 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Olfr351Q8VGK1 310 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Taf11Q99JX1 211 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Atp6v1g1Q9CR51 118 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Wdr55Q9CX97 388 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 FopnlQ9CZS3 174 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Spc24Q9D083 201 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Pgm1Q9D0F9 562 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 5330417H12RikQ9D3P2 110 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Gpn3Q9D3W4 284 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 2010109A12RikQ9D875 119 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Pnp2Q9D8C9 305 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Olfr630Q9EQQ7 319 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Slc13a1Q9JHI4 594 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 NsdhlQ9R1J0 362 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Rps6ka2Q9WUT3 733 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 AadatQ9WVM8 425 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Mrpl40Q9Z2Q5 206 aa8.39□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Gpr179E9PY61 2293 aa8.38□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Igkv6-32A0A140T8N9 115 aa8.38□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 FcmrA1KXC4 422 aa8.38□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Tcp11x2A2AEI7 503 aa8.38□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Mup6A2AV72 179 aa8.38□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Nipsnap3aB1AWZ3 247 aa8.38□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Mtx3D3YTP3 312 aa8.38□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 9630041A04RikD3Z3U4 205 aa8.38□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Gm3526E9PZM0 191 aa8.38□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Vmn2r76E9Q3F5 853 aa8.38□□□□□ -1.07
Rpusd1-201ENSMUST00000047273 Susd5G3UW60 619 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 51 ms