Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1J0

Nsdhl, Sterol-4-alpha-carboxylate 3-dehydrogenase, decarboxylating, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsdhlQ9R1J0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
NsdhlQ9R1J0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NsdhlQ9R1J0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NsdhlQ9R1J0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NsdhlQ9R1J0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NsdhlQ9R1J0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NsdhlQ9R1J0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NsdhlQ9R1J0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
NsdhlQ9R1J0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NsdhlQ9R1J0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NsdhlQ9R1J0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NsdhlQ9R1J0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NsdhlQ9R1J0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NsdhlQ9R1J0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NsdhlQ9R1J0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NsdhlQ9R1J0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NsdhlQ9R1J0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NsdhlQ9R1J0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NsdhlQ9R1J0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NsdhlQ9R1J0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NsdhlQ9R1J0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NsdhlQ9R1J0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NsdhlQ9R1J0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NsdhlQ9R1J0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NsdhlQ9R1J0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NsdhlQ9R1J0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NsdhlQ9R1J0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NsdhlQ9R1J0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NsdhlQ9R1J0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NsdhlQ9R1J0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NsdhlQ9R1J0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NsdhlQ9R1J0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NsdhlQ9R1J0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NsdhlQ9R1J0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NsdhlQ9R1J0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NsdhlQ9R1J0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NsdhlQ9R1J0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NsdhlQ9R1J0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NsdhlQ9R1J0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NsdhlQ9R1J0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NsdhlQ9R1J0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NsdhlQ9R1J0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NsdhlQ9R1J0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NsdhlQ9R1J0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NsdhlQ9R1J0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NsdhlQ9R1J0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NsdhlQ9R1J0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NsdhlQ9R1J0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NsdhlQ9R1J0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NsdhlQ9R1J0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NsdhlQ9R1J0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NsdhlQ9R1J0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NsdhlQ9R1J0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NsdhlQ9R1J0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NsdhlQ9R1J0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NsdhlQ9R1J0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NsdhlQ9R1J0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NsdhlQ9R1J0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NsdhlQ9R1J0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NsdhlQ9R1J0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NsdhlQ9R1J0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NsdhlQ9R1J0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NsdhlQ9R1J0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NsdhlQ9R1J0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NsdhlQ9R1J0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NsdhlQ9R1J0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NsdhlQ9R1J0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NsdhlQ9R1J0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NsdhlQ9R1J0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NsdhlQ9R1J0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NsdhlQ9R1J0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NsdhlQ9R1J0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NsdhlQ9R1J0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NsdhlQ9R1J0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NsdhlQ9R1J0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NsdhlQ9R1J0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NsdhlQ9R1J0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NsdhlQ9R1J0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NsdhlQ9R1J0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NsdhlQ9R1J0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NsdhlQ9R1J0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NsdhlQ9R1J0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NsdhlQ9R1J0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NsdhlQ9R1J0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NsdhlQ9R1J0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NsdhlQ9R1J0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NsdhlQ9R1J0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NsdhlQ9R1J0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NsdhlQ9R1J0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NsdhlQ9R1J0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NsdhlQ9R1J0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NsdhlQ9R1J0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NsdhlQ9R1J0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NsdhlQ9R1J0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NsdhlQ9R1J0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NsdhlQ9R1J0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NsdhlQ9R1J0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NsdhlQ9R1J0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NsdhlQ9R1J0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NsdhlQ9R1J0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms