Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Stx18Q8VDS8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,43■■■□□ 2,94
Stx18Q8VDS8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,91■■■□□ 2,86
Stx18Q8VDS8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Stx18Q8VDS8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Stx18Q8VDS8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,2■■■□□ 2,75
Stx18Q8VDS8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Stx18Q8VDS8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Stx18Q8VDS8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Stx18Q8VDS8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Stx18Q8VDS8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Stx18Q8VDS8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Stx18Q8VDS8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Stx18Q8VDS8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Stx18Q8VDS8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Stx18Q8VDS8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Stx18Q8VDS8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Stx18Q8VDS8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Stx18Q8VDS8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2,39
Stx18Q8VDS8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Stx18Q8VDS8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,91■■■□□ 2,38
Stx18Q8VDS8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
Stx18Q8VDS8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Stx18Q8VDS8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Stx18Q8VDS8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,34■■■□□ 2,29
Stx18Q8VDS8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Stx18Q8VDS8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Stx18Q8VDS8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Stx18Q8VDS8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Stx18Q8VDS8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Stx18Q8VDS8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
Stx18Q8VDS8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Stx18Q8VDS8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Stx18Q8VDS8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Stx18Q8VDS8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Stx18Q8VDS8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Stx18Q8VDS8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Stx18Q8VDS8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Stx18Q8VDS8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,75■■■□□ 2,19
Stx18Q8VDS8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Stx18Q8VDS8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Stx18Q8VDS8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
Stx18Q8VDS8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Stx18Q8VDS8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Stx18Q8VDS8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
Stx18Q8VDS8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Stx18Q8VDS8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Stx18Q8VDS8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Stx18Q8VDS8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Stx18Q8VDS8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Stx18Q8VDS8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Stx18Q8VDS8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Stx18Q8VDS8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Stx18Q8VDS8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Stx18Q8VDS8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Stx18Q8VDS8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Stx18Q8VDS8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Stx18Q8VDS8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Stx18Q8VDS8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,05■■■□□ 2,08
Stx18Q8VDS8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Stx18Q8VDS8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Stx18Q8VDS8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Stx18Q8VDS8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Stx18Q8VDS8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Stx18Q8VDS8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Stx18Q8VDS8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Stx18Q8VDS8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Stx18Q8VDS8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Stx18Q8VDS8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Stx18Q8VDS8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Stx18Q8VDS8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Stx18Q8VDS8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Stx18Q8VDS8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Stx18Q8VDS8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
Stx18Q8VDS8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Stx18Q8VDS8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Stx18Q8VDS8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Stx18Q8VDS8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Stx18Q8VDS8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Stx18Q8VDS8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Stx18Q8VDS8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Stx18Q8VDS8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,43■■□□□ 1,98
Stx18Q8VDS8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Stx18Q8VDS8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Stx18Q8VDS8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Stx18Q8VDS8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Stx18Q8VDS8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Stx18Q8VDS8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Stx18Q8VDS8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Stx18Q8VDS8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,95
Stx18Q8VDS8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Stx18Q8VDS8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Stx18Q8VDS8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Stx18Q8VDS8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Stx18Q8VDS8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Stx18Q8VDS8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Stx18Q8VDS8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Stx18Q8VDS8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Stx18Q8VDS8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Stx18Q8VDS8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51,6 ms