RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 HPSEQ9Y251 543 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 FRMPD4Q14CM0 1322 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC15A1P46059 708 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 CRISP1P54107 249 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 SCARB2Q14108 478 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 BTBD16Q32M84 506 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKDD1AQ495B1 522 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 NCSTNQ92542 709 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC35F4A4IF30 521 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 AGAP5A6NIR3 686 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD63C9JTQ0 380 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ATP6V1G1O75348 118 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 OTOP3Q7RTS5 596 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 HRGP04196 525 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 PKMP14618 531 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 CCR8P51685 355 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 PER3P56645 1201 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC9A9Q8IVB4 645 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM156AQ8NDB6 213 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ATG5Q9H1Y0 275 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 DCSTAMPQ9H295 470 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 P2RX2Q9UBL9 471 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 M0R233 179 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 RAP2AP10114 183 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 IL12RB2Q99665 862 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 XPNPEP2O43895 674 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 WDPCPO95876 746 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 BCL2A1Q16548 175 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 CPNE9Q8IYJ1 553 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC6A7Q99884 636 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC35A5Q9BS91 424 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 EBF3Q9H4W6 596 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 SDHAF3Q9NRP4 125 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM150CB9EJG8 249 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC31A1O15431 190 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 CDRT1O95170 752 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 C2P06681 752 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 MSI1O43347 362 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 CH25HO95992 272 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ADGRE1Q14246 886 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 NPTX1Q15818 432 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 PHF19Q5T6S3 580 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 C9orf131Q5VYM1 1079 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 KLHDC10Q6PID8 442 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 DPY19L4Q7Z388 723 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 CACNA1CQ13936 2221 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 COL6A2P12110 1019 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 CNTN2Q02246 1040 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 GBE1Q04446 702 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 BBS12Q6ZW61 710 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 OR52E4Q8NGH9 312 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM134Q9H6X4 195 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 KLRF1Q9NZS2 232 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 M0R2N6 131 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 PTF1AQ7RTS3 328 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ALPK1Q96QP1 1244 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 SCELO95171 688 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 TSTQ16762 297 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC58Q4VC31 144 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 LINGO4Q6UY18 593 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 IFNA5P01569 189 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 C8GP07360 202 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF773Q6PK81 442 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD23Q86SG2 305 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC28AQ8IWP9 274 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC30A2Q9BRI3 323 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 MYPNQ86TC9 1320 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 RP1P56715 2156 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 RIC1Q4ADV7 1423 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 SMIM30A4D0T7 59 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 C2orf74A8MZ97 194 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 TISP43B9A030 160 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 IDH3AP50213 366 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF781Q8N8C0 355 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 TLE6Q9H808 572 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A0U1RQK1 487 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 YDJCA8MPS7 323 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRJ-207ENST00000613246 RAB5BP61020 215 aa18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms