RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ERVW-1Q9UQF0 538 aa11.45□□□□□ -0.58
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP34Q70CQ2 3546 aa11.44□□□□□ -0.58
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A096LPI6 279 aa11.44□□□□□ -0.58
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H0YAE9 185 aa11.44□□□□□ -0.58
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ETHE1O95571 254 aa11.44□□□□□ -0.58
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RHOP08100 348 aa11.44□□□□□ -0.58
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIR3DL1P43629 444 aa11.44□□□□□ -0.58
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BDKRB1P46663 353 aa11.44□□□□□ -0.58
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPP2R2BQ00005 443 aa11.44□□□□□ -0.58
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNAB2Q13303 367 aa11.44□□□□□ -0.58
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRIF1Q5T3J3 769 aa11.44□□□□□ -0.58
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATG9BQ674R7 924 aa11.44□□□□□ -0.58
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF165Q6ZSG1 346 aa11.44□□□□□ -0.58
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF621Q6ZSS3 439 aa11.44□□□□□ -0.58
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIM74Q86UV6 250 aa11.44□□□□□ -0.58
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CALHM3Q86XJ0 350 aa11.44□□□□□ -0.58
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYT12Q8IV01 421 aa11.44□□□□□ -0.58
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa11.44□□□□□ -0.58
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