RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPATA24	Q86W54	205 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UNC93A	Q86WB7	457 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NAT14	Q8WUY8	206 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC126	Q96EE4	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BIRC8	Q96P09	236 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MCEE	Q96PE7	176 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VAT1	Q99536	393 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NDN	Q99608	321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CPNE1	Q99829	537 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	THTPA	Q9BU02	230 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DRC3	Q9H069	523 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DERA	Q9Y315	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525		H0Y3Z8	333 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525		H7C0C1	242 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VWA5A	O00534	786 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACKR2	O00590	384 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DCX	O43602	365 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CABYR	O75952	493 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STAMBP	O95630	424 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BAG2	O95816	211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZBED1	O96006	694 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCNE2	O96020	404 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	POLB	P06746	335 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MYL3	P08590	195 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MCF2	P10911	925 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HOXB2	P14652	356 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CD19	P15391	556 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PGAM1	P18669	254 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BGN	P21810	368 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MIP	P30301	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HTR7	P34969	479 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GP5	P40197	560 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAGEA12	P43365	314 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATP5O	P48047	213 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC1A6	P48664	564 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HCAR3	P49019	387 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NPY2R	P49146	381 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PSMD7	P51665	324 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CACNB3	P54284	484 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACTR2	P61160	394 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRKCE	Q02156	737 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SULT2A1	Q06520	285 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STX5	Q13190	355 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PDK3	Q15120	406 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CHI3L2	Q15782	390 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DPYSL2	Q16555	572 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STRADA	Q7RTN6	431 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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