RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mrps33Q9D2R8 106 aa10□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Glipr1l1Q9DAG6 236 aa10□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Abcb9Q9JJ59 762 aa10□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rpl38Q9JJI8 70 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Katna1Q9WV86 491 aa10□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r-ps130A0A140T8U3 855 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nt5c1aA3KFX0 365 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm13271B1AYH9 182 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pdia2D3Z6P0 527 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atp1b2P14231 290 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RhoP15409 348 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 G6pdxQ00612 515 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Plpp4Q0VBU9 271 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr381Q5SSP0 311 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Creb3Q61817 404 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fstl1Q62356 306 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pfkfb4Q6DTY7 469 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RimklaQ6PFX8 380 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hfe2Q7TQ32 420 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpat3Q8C0N2 438 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Casp9Q8C3Q9 454 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dcaf12l1Q8CBW4 501 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Etv3Q8R4Z4 513 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nrbf2Q8VCQ3 287 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nipal2Q91WC7 383 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ptgr1Q91YR9 329 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 5530400C23RikQ9D3I0 173 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sohlh2Q9D489 467 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adam24Q9R160 761 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lama2Q60675 3118 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Igkv16-104A0A0B4J1I1 116 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Elovl3O35949 271 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gnpda1O88958 289 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TyrP11344 533 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Etv4P28322 485 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Msr1P30204 458 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdh5P55284 784 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 OstnP61364 130 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MtpnP62774 118 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc30a3P97441 388 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Larp7Q05CL8 570 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Armc7Q3UJZ3 198 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krtcap2Q5RL79 136 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam167aQ6P1G6 215 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ube2r2Q6ZWZ2 238 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Letm2Q7TNU7 480 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ikzf5Q8BU00 419 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rdh12Q8BYK4 316 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Galnt13Q8CF93 556 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r214Q8R279 367 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r84Q8R284 318 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Uhrf1Q8VDF2 782 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem150aQ91WN2 271 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Det1Q9D0A0 550 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PacrglQ9D3X5 248 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam122aQ9DB52 284 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rgs3Q9DC04 966 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 IcmtQ9EQK7 283 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trpm6Q8CIR4 2028 aa9.99□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 1810010D01RikA0A1L1SR87 51 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm13089A2AGW7 455 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 F830016B08RikG3UWE2 416 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mkln1O89050 735 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TfamP40630 243 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GuloP58710 440 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Polr2lP62876 67 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Syce1lQ5D525 247 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp78Q5U406 512 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 OmpQ64288 163 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lix1Q6P566 282 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pex11gQ6P6M5 241 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1080Q7TR67 313 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hamp2Q80T19 83 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 IfneQ80ZF2 192 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpr22Q8BZL4 432 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ppp4r4Q8C0Y0 875 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TiparpQ8C1B2 657 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sept11Q8C1B7 431 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fbxl3Q8C4V4 428 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rab36Q8CAM5 267 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc29a4Q8R139 528 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr437Q8VEV1 310 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr357Q8VFP4 308 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Elp2Q91WG4 831 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf639Q99KZ6 485 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dpy30Q99LT0 99 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Efcab1Q9D3N2 212 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Necab3Q9D6J4 353 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Haus5Q9D786 619 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm29776A0A286YEC0 699 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm14781A2A9Q9 366 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sema6aO35464 1031 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ComtO88587 265 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P06324 132 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PamP97467 979 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Eps8Q08509 821 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mageb5Q14AN0 366 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tfap2cQ61312 449 aa9.98□□□□□ -0.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tas2r131Q7M708 310 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.2 ms